More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0047 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0047  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 80 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284313  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0182  transcriptional regulator, LuxR family  82.54 
 
 		 85 aa  107  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0096  transcriptional regulator, LuxR family  74.65 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03170  ATP-dependent transcriptional regulator  45.71 
 
 		 868 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3120  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  44.78 
 
 		 854 aa  62  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  47.06 
 
 		 884 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2158  LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 491 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  44 
 
 		 905 aa  60.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3664  regulatory protein, LuxR  47.62 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1633  regulatory protein, LuxR  42.42 
 
 		 732 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  37.14 
 
 		 496 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  39.13 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3813  PAS sensor protein  41.79 
 
 		 500 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0475  regulatory protein LuxR  53.33 
 
 		 271 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2725  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2316  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2386  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2509  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.592216  hitchhiker  0.00000482381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2332  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2440  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000119534  normal  0.0380024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2490  transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1832  LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1788  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1796  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  46.97 
 
 		 846 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4133  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  43.75 
 
 		 749 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1446  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0167897  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2114  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000451621  normal  0.459179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4460  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 486 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.478893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1056  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 497 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1072  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  normal  0.0679961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5649  LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 486 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.090782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1083  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.605869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  37.35 
 
 		 562 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6717  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 509 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  41.43 
 
 		 947 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.91 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 199 aa  53.5  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1337  regulatory protein, LuxR  45 
 
 		 188 aa  53.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36550  ATP-dependent transcriptional regulator  45.16 
 
 		 846 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0994  response regulator receiver domain-containing protein  38.16 
 
 		 221 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06533  hypothetical protein  47.37 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  42.42 
 
 		 335 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1726  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.474249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4809  regulatory protein, LuxR  44.26 
 
 		 717 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17127 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001275  transcriptional regulator VpsT  34.78 
 
 		 222 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 781 aa  52  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0210  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 500 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03493  hypothetical protein  38.46 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  40.98 
 
 		 916 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1057  transcriptional regulator, LuxR family  41.27 
 
 		 486 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4001  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.3 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  42.67 
 
 		 873 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0766  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  43.55 
 
 		 840 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2327  regulatory protein, LuxR  44.44 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1517  transcriptional regulator, LuxR family protein  46.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.776537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  43.1 
 
 		 896 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3217  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  43.48 
 
 		 891 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000769208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0393  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 486 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 210 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1817  LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 211 aa  51.6  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.596206  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001276  transcriptional regulator VpsT  41.1 
 
 		 210 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2254  LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000750634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  41.67 
 
 		 758 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 514 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2536  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  48.08 
 
 		 216 aa  50.8  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5099  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  41.18 
 
 		 900 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2759  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 211 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.550861  normal  0.145492 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0923  ATP-dependent transcription regulator LuxR  49.12 
 
 		 1235 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 510 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 510 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 514 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2281  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  48.21 
 
 		 730 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 514 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 234 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0745  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  41.56 
 
 		 895 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.27 
 
 		 930 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1356  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  37.68 
 
 		 917 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 215 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 208 aa  50.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0211915  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0287  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 224 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1053  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0295  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  44.07 
 
 		 901 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3823  transcriptional regulator MalT  44.07 
 
 		 901 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0029  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.268532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  41.67 
 
 		 218 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3714  transcriptional regulator MalT  44.07 
 
 		 901 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5618  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.43 
 
 		 1383 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586723 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3831  transcriptional regulator MalT  44.07 
 
 		 901 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3129  transcriptional regulator MalT  43.1 
 
 		 914 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0535917  decreased coverage  0.00386402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>