More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0043 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  58.14 
 
 		 304 aa  321  7e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0432  transcriptional regulator, LysR family  42.43 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3621  LysR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 307 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 288 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  34.56 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  40.49 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  35.43 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 306 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  35.71 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 311 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  36.23 
 
 		 328 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 314 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  34.14 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  34.63 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  39.57 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 306 aa  98.2  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.6 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  33.86 
 
 		 303 aa  97.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 350 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 338 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  32.94 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  36.19 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  31.69 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1423  LysR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 339 aa  92.4  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  29.47 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  31.39 
 
 		 308 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01661  putative Rubisco transcriptional regulator  29.13 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01641  putative Rubisco transcriptional regulator  29.13 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.569388  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01751  putative Rubisco transcriptional regulator  28.35 
 
 		 317 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.348697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  34.82 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0149  putative Rubisco transcriptional regulator  29.08 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  35.09 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  31.44 
 
 		 308 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4274  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1719  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 332 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  32.26 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 304 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 306 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4595  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6414  LysR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.632456  normal  0.773226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4731  LysR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 333 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1306  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.383591  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  30.64 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2277  transcriptional regulator, LysR family  30.47 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6838  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  32.79 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4789  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3242  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 301 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.783996  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0385  LysR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.980555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5976  LysR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>