59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0015 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0015  peptidase C60 sortase A and B  100 
 
 
270 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  50.76 
 
 
268 aa  251  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0023  sortase family protein  54.07 
 
 
276 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0027  sortase family protein  50.83 
 
 
238 aa  215  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.6084  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  41.15 
 
 
412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0017  sortase family protein  44.36 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.428666  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0017  sortase family protein  44.16 
 
 
260 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000184176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03380  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  41.77 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0029  sortase family protein  38.98 
 
 
368 aa  171  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  42.04 
 
 
323 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27020  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  43.75 
 
 
243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  39.84 
 
 
249 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0839  sortase family protein  41.13 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0134  sortase family protein  42.01 
 
 
218 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0283  sortase family protein  40.16 
 
 
242 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.741902  normal  0.0594154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  38.63 
 
 
556 aa  132  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  39.21 
 
 
229 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00300  sortase (surface protein transpeptidase)  33.95 
 
 
298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.506527  normal  0.0714167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  35.47 
 
 
192 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  38.56 
 
 
238 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0017  sortase family protein  35.94 
 
 
353 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1682  peptidase C60 sortase A and B  37.13 
 
 
316 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  35.19 
 
 
521 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6133  sortase family protein  35.11 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0035  sortase family protein  40.98 
 
 
251 aa  112  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.143282  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0073  peptidase C60 sortase A and B  36.11 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  30.54 
 
 
262 aa  92.8  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5903  sortase family protein  32 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  31.3 
 
 
268 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.2 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  27.35 
 
 
220 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  32.28 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3502  sortase family protein  35.81 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  26.58 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  31.5 
 
 
187 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  28.42 
 
 
197 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  30.56 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  36.61 
 
 
269 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  29.63 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0149  sortase family protein  33.33 
 
 
205 aa  53.9  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  25.85 
 
 
265 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  25.17 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  29.93 
 
 
292 aa  52  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0123  sortase (surface protein transpeptidase)-like  27.83 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.592516  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  37.5 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  27.4 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.03 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  28.42 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  28.12 
 
 
302 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0919  peptidase C60, sortase A and B  33.04 
 
 
328 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.372498  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  27.97 
 
 
377 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  23.14 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0073  peptidase C60 sortase A and B  31.37 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.787653  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  30.77 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  31.51 
 
 
216 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  24 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2799  peptidase C60, sortase A and B  32.37 
 
 
218 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  23.55 
 
 
233 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  22.73 
 
 
236 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>