53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0005 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0005  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 171 aa  326  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  63.58 
 
 		 196 aa  175  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0005  protein of unknown function DUF721  67.23 
 
 		 173 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0005  hypothetical protein  55.35 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  58.2 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0005  protein of unknown function DUF721  60.8 
 
 		 217 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0823  hypothetical protein  45.51 
 
 		 188 aa  140  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  49.08 
 
 		 196 aa  137  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0005  protein of unknown function DUF721  46.34 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000106889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0005  hypothetical protein  45.56 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.342856  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0005  protein of unknown function DUF721  55.56 
 
 		 207 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0005  hypothetical protein  43.41 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731239  normal  0.310544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0005  hypothetical protein  49.35 
 
 		 183 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0006  Zn-ribbon-containing possibly RNA-binding protein and truncated derivatives-like protein  55.56 
 
 		 206 aa  121  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0005  hypothetical protein  41.81 
 
 		 190 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.935209  normal  0.0649143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0013  hypothetical protein  41.81 
 
 		 190 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0005  hypothetical protein  41.81 
 
 		 190 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0005  protein of unknown function DUF721  49.6 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0004  protein of unknown function DUF721  50 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00476655  normal  0.0907524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00040  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  45.83 
 
 		 266 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.221602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0008  protein of unknown function DUF721  47.24 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10004  hypothetical protein  46.4 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0004  protein of unknown function DUF721  44.09 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  43.75 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0005  protein of unknown function DUF721  51.2 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00151548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0005  hypothetical protein  42.61 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0005  protein of unknown function DUF721  44.93 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0005  protein of unknown function DUF721  46.09 
 
 		 188 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0004  hypothetical protein  41.01 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0005  hypothetical protein  44.7 
 
 		 273 aa  99  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0987513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0005  hypothetical protein  43.93 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0499719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0005  hypothetical protein  39.84 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0006  hypothetical protein  45.79 
 
 		 198 aa  95.5  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00159718  hitchhiker  0.00351653 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0005  hypothetical protein  44.23 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000127236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00050  predicted RNA-binding protein containing Zn ribbon  44.09 
 
 		 217 aa  90.5  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00080644  normal  0.335319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0005  protein of unknown function DUF721  44.55 
 
 		 117 aa  85.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0042  hypothetical protein  31.43 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  30.09 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0005  hypothetical protein  30 
 
 		 300 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0643796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3498  protein of unknown function DUF721  27.66 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.68574e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3436  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00123738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  24.73 
 
 		 97 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1258  hypothetical protein  30.68 
 
 		 169 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  28.24 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  27.27 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2995  hypothetical protein  31.03 
 
 		 266 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.333747  normal  0.629228 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1777  hypothetical protein  29 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0004  hypothetical protein  23.08 
 
 		 97 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.52078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  24.44 
 
 		 97 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04851  hypothetical protein  31.15 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0004  hypothetical protein  26.09 
 
 		 96 aa  41.6  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.132864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0164  hypothetical protein  29 
 
 		 185 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>