263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5032 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_5032  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
157 aa  311  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3202  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  46.71 
 
 
323 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10021  hypothetical protein  51.33 
 
 
322 aa  123  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3068  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.05 
 
 
323 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0899956  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8517  2-nitropropane dioxygenase NPD  53.9 
 
 
326 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1082  2-nitropropane dioxygenase NPD  52.6 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707108  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4715  putative 2-nitropropane dioxygenase  45.45 
 
 
333 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2787  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.14 
 
 
331 aa  101  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4881  2-nitropropane dioxygenase NPD  40.4 
 
 
320 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0206  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.52 
 
 
348 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  37.18 
 
 
338 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  36.6 
 
 
345 aa  77.4  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.64 
 
 
325 aa  74.7  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  32.68 
 
 
323 aa  74.7  0.0000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1222  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.11 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
376 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  30.46 
 
 
317 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2858  2-nitropropane dioxygenase NPD  30 
 
 
316 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.87 
 
 
323 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5586  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.76 
 
 
305 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6053  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.76 
 
 
335 aa  70.5  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.483236  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.95 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.95 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.95 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0346  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  35.95 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.182837  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7097  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.4 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4144  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.52 
 
 
366 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  31.37 
 
 
316 aa  68.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5355  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.19 
 
 
328 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0922  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.41 
 
 
319 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3013  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.32 
 
 
324 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3732  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.32 
 
 
324 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0896  hypothetical protein  31.69 
 
 
351 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.467811  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1401  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.21 
 
 
324 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0363  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.85 
 
 
325 aa  67.8  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09580  hypothetical protein  31.15 
 
 
351 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  33.56 
 
 
321 aa  67.8  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5156  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.86 
 
 
317 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.707988  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3001  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.26 
 
 
328 aa  67.4  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.152083  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5146  putative 2-nitropropane dioxygenase  32.89 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199752  normal  0.0588296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2480  2-nitropropane dioxygenase, NPD  43.18 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459764  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1075  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.77 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.95 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.2 
 
 
317 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6745  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.32 
 
 
367 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.566568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1215  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.84 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1232  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.84 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.86313 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.68 
 
 
323 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4537  2-nitropropane dioxygenase, NPD  40.94 
 
 
318 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262388  normal  0.792833 
 
 
-
 
NC_002950  PG1416  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.05 
 
 
313 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.578712 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7089  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.78 
 
 
329 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0431  trans-2-enoyl-ACP reductase II  36.6 
 
 
321 aa  63.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2774  2-nitropropane dioxygenase, NPD  31.28 
 
 
344 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3758  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.55 
 
 
334 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.07 
 
 
331 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1242  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.5 
 
 
295 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.09 
 
 
378 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0580  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.35 
 
 
312 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3833  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.32 
 
 
324 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.72 
 
 
353 aa  61.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.63 
 
 
319 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  28.09 
 
 
363 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0471  dioxygenase  29.67 
 
 
359 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4869  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.35 
 
 
366 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1554  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.32 
 
 
324 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1606  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.37 
 
 
366 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433617  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3609  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.39 
 
 
323 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.05 
 
 
354 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  28.09 
 
 
364 aa  58.9  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0800  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.94 
 
 
325 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3305  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.32 
 
 
352 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3902  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30 
 
 
346 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.721372  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5534  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.22 
 
 
323 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2459  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.33 
 
 
353 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.36207 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0474  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.19 
 
 
353 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05464  oxidoreductase protein  29.38 
 
 
362 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.103651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0946  2-nitropropane dioxygenase, NPD  34.9 
 
 
313 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00349563  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.61 
 
 
363 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0476  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.13 
 
 
353 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1628  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.28 
 
 
366 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.879013 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3745  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.96 
 
 
356 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0279  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.77 
 
 
357 aa  57.4  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4822  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.96 
 
 
356 aa  57.4  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6053  2-nitropropane dioxygenase NPD  34.18 
 
 
341 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_002978  WD1170  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  30.37 
 
 
342 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  26.97 
 
 
364 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4296  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.61 
 
 
332 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.458916  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6828  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.17 
 
 
325 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670939  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4067  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.61 
 
 
332 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4142  2-nitropropane dioxygenase, NPD  29.61 
 
 
332 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  27.53 
 
 
364 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  26.97 
 
 
364 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  27.53 
 
 
364 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3064  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.22 
 
 
311 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.21 
 
 
366 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  24.58 
 
 
355 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  24.58 
 
 
355 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.43 
 
 
350 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.14 
 
 
321 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  28.09 
 
 
363 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>