118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4973 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  37.54 
 
 		 1669 aa  861    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  36.94 
 
 		 1669 aa  861    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  32.56 
 
 		 1726 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  34.03 
 
 		 1706 aa  717    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  76.29 
 
 		 1703 aa  2615    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  80.73 
 
 		 1700 aa  2748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  80.04 
 
 		 1516 aa  2473    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  34.51 
 
 		 1575 aa  741    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  31.65 
 
 		 1649 aa  733    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  36.52 
 
 		 1642 aa  874    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  31.62 
 
 		 1932 aa  702    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  79.56 
 
 		 1748 aa  2725    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  74.78 
 
 		 1702 aa  2563    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  82 
 
 		 1417 aa  2297    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1697 aa  3437    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  55.06 
 
 		 1693 aa  1767    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  34.69 
 
 		 1606 aa  744    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  33.8 
 
 		 2077 aa  892    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  73.46 
 
 		 1211 aa  1730    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  76.6 
 
 		 1697 aa  2654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  76.84 
 
 		 1701 aa  2603    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  31.03 
 
 		 1934 aa  680    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  33.4 
 
 		 2098 aa  775    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  28.89 
 
 		 2274 aa  635  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  67.8 
 
 		 470 aa  603  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 2570 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  31.5 
 
 		 1956 aa  570  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 1674 aa  539  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  27.65 
 
 		 2117 aa  532  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 1594 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.33 
 
 		 1722 aa  466  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  35.04 
 
 		 976 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  33.05 
 
 		 2005 aa  415  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  60.98 
 
 		 284 aa  339  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  31.05 
 
 		 763 aa  238  8e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  29.53 
 
 		 761 aa  231  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  64.48 
 
 		 246 aa  215  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  36.6 
 
 		 1925 aa  199  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  27.23 
 
 		 766 aa  187  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 577 aa  186  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  22.9 
 
 		 1328 aa  137  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  26.54 
 
 		 526 aa  126  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7033  hypothetical protein  63.86 
 
 		 97 aa  103  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  30.8 
 
 		 339 aa  99.8  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  30.36 
 
 		 341 aa  80.5  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  29.96 
 
 		 341 aa  79.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  31.21 
 
 		 678 aa  74.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  21.99 
 
 		 1379 aa  73.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  32.69 
 
 		 254 aa  68.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  36.78 
 
 		 894 aa  60.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  37.19 
 
 		 285 aa  59.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 968 aa  56.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 1116 aa  56.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  35.05 
 
 		 1046 aa  56.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 986 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.65 
 
 		 1147 aa  54.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  32.9 
 
 		 423 aa  55.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  24.38 
 
 		 442 aa  54.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  24.87 
 
 		 933 aa  54.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  22.77 
 
 		 929 aa  54.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  33.33 
 
 		 466 aa  53.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.05 
 
 		 1160 aa  53.9  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  25.42 
 
 		 503 aa  52.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  31.09 
 
 		 900 aa  52.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  24.5 
 
 		 958 aa  52  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  42.31 
 
 		 950 aa  51.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  36.99 
 
 		 889 aa  51.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  36.14 
 
 		 953 aa  51.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  29.41 
 
 		 969 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  30.38 
 
 		 945 aa  50.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  31.58 
 
 		 958 aa  50.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  33.33 
 
 		 957 aa  51.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  37.33 
 
 		 922 aa  50.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  30.69 
 
 		 468 aa  49.3  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.71 
 
 		 960 aa  48.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.97 
 
 		 1095 aa  48.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  24.75 
 
 		 1177 aa  48.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  39.29 
 
 		 840 aa  48.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  25.18 
 
 		 1082 aa  48.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  24.06 
 
 		 1058 aa  48.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  33.82 
 
 		 1145 aa  48.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  33.75 
 
 		 941 aa  48.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  27.69 
 
 		 973 aa  48.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  33.68 
 
 		 1117 aa  48.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  30.71 
 
 		 924 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  32.98 
 
 		 1201 aa  47.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  28.05 
 
 		 1065 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  28.05 
 
 		 1065 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  29.46 
 
 		 1170 aa  47.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  32.98 
 
 		 1201 aa  47.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.64 
 
 		 557 aa  47.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.25 
 
 		 489 aa  47.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  22.39 
 
 		 947 aa  47.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  28.43 
 
 		 964 aa  47.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  31.08 
 
 		 910 aa  47.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  46.94 
 
 		 972 aa  47  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  32.94 
 
 		 928 aa  47.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 941 aa  47  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 941 aa  47  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  27.59 
 
 		 235 aa  47  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>