161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4949 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  100 
 
 		 207 aa  415  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  55.78 
 
 		 204 aa  194  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  47.22 
 
 		 182 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  46.33 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3658  cytochrome B561  45.61 
 
 		 179 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.76446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  45.56 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4513  cytochrome B561  45.88 
 
 		 177 aa  148  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299836  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6037  cytochrome B561  44.32 
 
 		 181 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151215  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1227  cytochrome B561  41.67 
 
 		 175 aa  148  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.168026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  47.49 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  48.07 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  43.2 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5579  cytochrome b561 family protein  43.6 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.851973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  42.63 
 
 		 210 aa  141  9e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  40.57 
 
 		 181 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  42.51 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  41.76 
 
 		 192 aa  138  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  40.12 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2354  putative transmembrane hydrogenase cytochrome B- type subunit  42.6 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  38.59 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  38.04 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1211  cytochrome B561  44.38 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  37.5 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  38.59 
 
 		 198 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  38.59 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4627  cytochrome B561  44.97 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.176901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  38.59 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  37.69 
 
 		 255 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  38.59 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  38.59 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1811  cytochrome B561  43.02 
 
 		 184 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  38.04 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1933  cytochrome B561  45.76 
 
 		 185 aa  125  6e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  36.6 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0526  cytochrome B561  41.14 
 
 		 190 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  41.67 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0510  cytochrome B561  41.28 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0112107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  37.02 
 
 		 237 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  34.42 
 
 		 214 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10120  cytochrome b561 family protein  38.73 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220125  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  36.97 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  40.32 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0655  hypothetical protein  38.82 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  36.47 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  33.65 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  37.5 
 
 		 193 aa  111  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  37.36 
 
 		 242 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0475  cytochrome b  38.04 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2127  cytochrome B561  38.04 
 
 		 199 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  40 
 
 		 349 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  40.11 
 
 		 245 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  39.38 
 
 		 245 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  37.93 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  32.78 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  32.96 
 
 		 231 aa  104  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  31.35 
 
 		 387 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  39.89 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  35.75 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  34.95 
 
 		 230 aa  99  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  35.36 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  35.36 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  29.1 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  33.16 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1784  cytochrome B561  34.92 
 
 		 241 aa  94  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2397  cytochrome B561  36.96 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0117421  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0473  cytochrome B561  32.04 
 
 		 226 aa  92.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.323429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  32.42 
 
 		 230 aa  92.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  37.63 
 
 		 363 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2545  cytochrome B561  36.07 
 
 		 193 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3906  cytochrome B561  30.77 
 
 		 219 aa  92  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  32.04 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  37.63 
 
 		 363 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0461  cytochrome b561  32.77 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1061  cytochrome B561  33.33 
 
 		 230 aa  89  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0113  cytochrome B561  28.93 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2690  cytochrome B561  35 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117812  normal  0.0669549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1170  cytochrome b561  31.91 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1265  cytochrome B561  28.57 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348769 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0900  b-type cytochrome, putative  35.2 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.983268  normal  0.508758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  30.3 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  32.47 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  30.65 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  32.47 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  34.62 
 
 		 219 aa  81.3  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03472  Cytochrome b561 family protein  26.92 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  32.47 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3588  cytochrome B561  34.81 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  31.15 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  30.46 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3421  b-type cytochrome, putative  36.13 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0326  cytochrome B561  29.06 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  25.81 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1074  cytochrome B561  36.8 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0236841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  29.83 
 
 		 265 aa  75.1  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1406  cytochrome B561  30.69 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  26.83 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2491  cytochrome B561  28.77 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.114996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1795  cytochrome B561  28.77 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1787  cytochrome B561  28.77 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0599  cytochrome B561  30.27 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>