More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4913 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  62.75 
 
 
763 aa  944    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  48.71 
 
 
757 aa  680    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  48.71 
 
 
757 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  48.23 
 
 
757 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  48.71 
 
 
757 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.59 
 
 
777 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  48.71 
 
 
757 aa  680    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.58 
 
 
757 aa  679    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
765 aa  1538    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  48.71 
 
 
757 aa  680    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  48.71 
 
 
757 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2822  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.86 
 
 
412 aa  246  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2828  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.57 
 
 
410 aa  240  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0467884  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1897  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.16 
 
 
411 aa  232  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.962296  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1295  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.69 
 
 
406 aa  232  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.03 
 
 
415 aa  231  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.920633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2188  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.32 
 
 
482 aa  231  5e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.43 
 
 
416 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.090835  normal  0.217148 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1914  hypothetical protein  37.1 
 
 
334 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5300  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.7 
 
 
405 aa  222  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.700075  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0803  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.59 
 
 
409 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0376113 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0127  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.77 
 
 
406 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000254021  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.46 
 
 
413 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186755  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.05 
 
 
527 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1925  hypothetical protein  36.92 
 
 
339 aa  217  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.34 
 
 
417 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 
396 aa  217  5.9999999999999996e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5421  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.64 
 
 
508 aa  217  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6775  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.74 
 
 
415 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194006  normal  0.16811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  37.11 
 
 
410 aa  213  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0729  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.39 
 
 
409 aa  211  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.81 
 
 
512 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0683  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.39 
 
 
409 aa  210  8e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2616  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.03 
 
 
392 aa  210  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.170748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.41 
 
 
410 aa  210  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.81 
 
 
512 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.52 
 
 
509 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194312 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.48 
 
 
420 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  35.83 
 
 
427 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1397  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.6 
 
 
509 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.6 
 
 
509 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  38.46 
 
 
385 aa  207  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4269  Patatin  36.96 
 
 
420 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.59934  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4379  Patatin  36.96 
 
 
420 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.227942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3641  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.65 
 
 
410 aa  205  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0834548  normal  0.076531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  35.2 
 
 
423 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  36.95 
 
 
417 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3061  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.31 
 
 
418 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1971  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.73 
 
 
407 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.948495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3909  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.94 
 
 
415 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6204  Patatin  35.75 
 
 
378 aa  200  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.80155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3785  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.04 
 
 
401 aa  199  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0381665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4591  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.42 
 
 
400 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17489  normal  0.560955 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.89 
 
 
416 aa  198  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4836  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.91 
 
 
420 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2738  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.05 
 
 
385 aa  198  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263626  normal  0.288429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  35.25 
 
 
429 aa  197  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10702  ferredoxin reductase  37.22 
 
 
406 aa  197  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2641  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.39 
 
 
412 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319989  normal  0.949284 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3281  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
399 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0482822  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1305  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.24 
 
 
420 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3230  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
399 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180349  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3219  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.35 
 
 
399 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.241192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0900  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.77 
 
 
401 aa  195  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  37.21 
 
 
378 aa  195  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0917  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.29 
 
 
413 aa  195  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.77013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  36.03 
 
 
442 aa  194  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3006  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.23 
 
 
401 aa  194  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2559  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.5 
 
 
401 aa  194  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  35.96 
 
 
405 aa  194  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.64 
 
 
413 aa  194  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.068301  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02397  putative transmembrane protein  34.87 
 
 
377 aa  193  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.104475  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  34.11 
 
 
389 aa  193  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.64 
 
 
413 aa  193  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0727067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3124  patatin  35.57 
 
 
405 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  36.21 
 
 
405 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5147  patatin  36.21 
 
 
405 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.569515  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4849  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
401 aa  193  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  36.21 
 
 
405 aa  193  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3656  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.42 
 
 
405 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.95 
 
 
506 aa  192  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4981  patatin  35.57 
 
 
405 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  32.29 
 
 
371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  32.29 
 
 
371 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.7 
 
 
506 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  37.99 
 
 
386 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6979  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.2 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1802  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.88 
 
 
405 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4603  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.21 
 
 
416 aa  192  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1520  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.87 
 
 
421 aa  192  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0962698  normal  0.493273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4688  Patatin  37.14 
 
 
379 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1647  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.69 
 
 
409 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  35.36 
 
 
379 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3463  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.31 
 
 
401 aa  190  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  34.44 
 
 
387 aa  190  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1960  patatin  34.38 
 
 
417 aa  190  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.508656  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2728  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.75 
 
 
415 aa  190  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.15874  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  35.36 
 
 
379 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3081  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.46 
 
 
397 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176736  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1407  patatin  36.47 
 
 
390 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>