63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4893 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  100 
 
 		 1417 aa  2871    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  81.84 
 
 		 1211 aa  1513    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  77.69 
 
 		 1697 aa  2235    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  31.33 
 
 		 1932 aa  646    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  37.36 
 
 		 1642 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  78.83 
 
 		 1701 aa  2224    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  36.24 
 
 		 2077 aa  811    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  34.74 
 
 		 1575 aa  660    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  33.11 
 
 		 2098 aa  726    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  35.46 
 
 		 1606 aa  670    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  84.76 
 
 		 1516 aa  2116    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  56.64 
 
 		 1693 aa  1555    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  87 
 
 		 1700 aa  2456    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  75.04 
 
 		 1703 aa  2135    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  33.82 
 
 		 1706 aa  659    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  34.15 
 
 		 1726 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  85.51 
 
 		 1748 aa  2426    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  37.29 
 
 		 1669 aa  749    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  37.28 
 
 		 1669 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  76.46 
 
 		 1702 aa  2178    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  81.79 
 
 		 1697 aa  2299    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  33.52 
 
 		 1925 aa  631  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  32.81 
 
 		 1649 aa  632  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  30.58 
 
 		 1934 aa  622  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  69.49 
 
 		 470 aa  602  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  28.46 
 
 		 2570 aa  535  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  30.91 
 
 		 1722 aa  521  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 1594 aa  522  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  26.82 
 
 		 2117 aa  509  9.999999999999999e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  30.73 
 
 		 1956 aa  505  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 1674 aa  505  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.57 
 
 		 2274 aa  387  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  35.01 
 
 		 976 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  32.75 
 
 		 2005 aa  332  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  59.58 
 
 		 284 aa  320  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  65.59 
 
 		 246 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 761 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  31.99 
 
 		 763 aa  179  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  33.46 
 
 		 577 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  28.42 
 
 		 766 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  23.6 
 
 		 1328 aa  92.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  34.86 
 
 		 526 aa  88.2  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  30.34 
 
 		 341 aa  83.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  30.83 
 
 		 339 aa  84  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  30.25 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  28.22 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 		 503 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.95 
 
 		 557 aa  57.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  22.5 
 
 		 1379 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  33.07 
 
 		 285 aa  53.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  31.82 
 
 		 423 aa  53.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  30.19 
 
 		 678 aa  53.5  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  26.71 
 
 		 527 aa  53.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  33.59 
 
 		 466 aa  52.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  26.26 
 
 		 484 aa  50.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4383  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.71 
 
 		 489 aa  50.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  25.47 
 
 		 481 aa  49.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  25.64 
 
 		 1343 aa  48.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  27.91 
 
 		 553 aa  46.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  26.01 
 
 		 490 aa  45.8  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3999  N-6 DNA methylase  22.7 
 
 		 523 aa  45.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00695181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  26.77 
 
 		 562 aa  45.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 605 aa  45.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>