89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4788 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4788    100 
 
 		 141 bp  280  9e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  unclonable  0.0000000000240713  unclonable  0.000000000279001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3174  50S ribosomal protein L14  91.75 
 
 		 369 bp  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.992271  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5060  50S ribosomal protein L14  90.72 
 
 		 369 bp  121  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.750337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1785  50S ribosomal protein L14P  93.67 
 
 		 369 bp  117  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0194181  normal  0.0829617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3657  50S ribosomal protein L14  92.59 
 
 		 369 bp  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1555  50S ribosomal protein L14  89.58 
 
 		 369 bp  111  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2305  50S ribosomal protein L14  89.58 
 
 		 369 bp  111  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0162624  normal  0.103415 
 
 
-
 
NC_004310  BR1223  50S ribosomal protein L14  94.37 
 
 		 369 bp  109  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1186  50S ribosomal protein L14  94.37 
 
 		 369 bp  109  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.367223  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1668  50S ribosomal protein L14  94.37 
 
 		 369 bp  109  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0136083  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1374  50S ribosomal protein L14  91.36 
 
 		 369 bp  105  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439933  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2469  50S ribosomal protein L14  87.88 
 
 		 360 bp  101  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1342  50S ribosomal protein L14  93.85 
 
 		 369 bp  97.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0385141  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1440  50S ribosomal protein L14  93.85 
 
 		 369 bp  97.6  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4594  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3438  50S ribosomal protein L14  87.63 
 
 		 369 bp  97.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1850  50S ribosomal protein L14  93.85 
 
 		 369 bp  97.6  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1966  50S ribosomal protein L14  91.55 
 
 		 369 bp  93.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00306344  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2191  50S ribosomal protein L14  86.87 
 
 		 369 bp  93.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2154  50S ribosomal protein L14  86.87 
 
 		 360 bp  93.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.776638 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0343  50S ribosomal protein L14  86.87 
 
 		 369 bp  93.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0996  50S ribosomal protein L14  91.55 
 
 		 369 bp  93.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0292243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2208  50S ribosomal protein L14  86.6 
 
 		 369 bp  89.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1364  50S ribosomal protein L14  86.6 
 
 		 369 bp  89.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279063  normal  0.0203367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2746  50S ribosomal protein L14  86.96 
 
 		 369 bp  87.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.014298  normal  0.185382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1918  50S ribosomal protein L14  85.86 
 
 		 360 bp  85.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  85.71 
 
 		 369 bp  83.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0570  50S ribosomal protein L14  88.46 
 
 		 369 bp  83.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1624  50S ribosomal protein L14  86.17 
 
 		 369 bp  83.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118658  normal  0.312763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0769  50S ribosomal protein L14  87.65 
 
 		 369 bp  81.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.234537  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  87.01 
 
 		 369 bp  73.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 369 bp  73.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  87.01 
 
 		 369 bp  73.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  91.07 
 
 		 369 bp  71.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  84 
 
 		 369 bp  71.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  97.3 
 
 		 369 bp  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  100 
 
 		 369 bp  65.9  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  85.71 
 
 		 369 bp  65.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1343  50S ribosomal protein MRPL14P  93.33 
 
 		 372 bp  65.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2678  50S ribosomal protein L14P  97.3 
 
 		 369 bp  65.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0216  50S ribosomal protein L14  90.57 
 
 		 366 bp  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1133  ribosomal protein L14  94.74 
 
 		 369 bp  60  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2976  50S ribosomal protein L14  94.59 
 
 		 369 bp  58  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6604  ribosomal protein L14  96.97 
 
 		 369 bp  58  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1175  50S ribosomal protein L14  94.59 
 
 		 369 bp  58  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.095268  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  96.97 
 
 		 369 bp  58  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  96.97 
 
 		 369 bp  58  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  82.61 
 
 		 369 bp  56  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  94.29 
 
 		 369 bp  54  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0259  ribosomal protein L14  94.29 
 
 		 489 bp  54  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00518224  hitchhiker  0.00445283 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1259  50S ribosomal protein L14  94.29 
 
 		 369 bp  54  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.959032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1195  50S ribosomal protein L14  94.29 
 
 		 369 bp  54  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3895  50S ribosomal protein L14  93.94 
 
 		 369 bp  50.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3995  ribosomal protein L14  91.89 
 
 		 369 bp  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219417  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  93.94 
 
 		 369 bp  50.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0415  50S ribosomal protein L14  91.89 
 
 		 369 bp  50.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000011877  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1350  ribosomal protein L14  93.94 
 
 		 369 bp  50.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1236  50S ribosomal protein L14  87.5 
 
 		 372 bp  48.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.438717  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0943  50S ribosomal protein L14  91.67 
 
 		 369 bp  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00200525  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2159  ribosomal protein L14  82.14 
 
 		 369 bp  48.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  0.234702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3318  50S ribosomal protein L14  91.67 
 
 		 369 bp  48.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000362831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4497  ribosomal protein L14  93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2622  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  93.55 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3794  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.322592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0431  50S ribosomal protein L14P  81.61 
 
 		 372 bp  46.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0205903  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2749  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000157249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0277  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000632835  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0358  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000852888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3058  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000279075  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3159  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000901692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1934  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000033095  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3457  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989644  decreased coverage  0.00422034 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3736  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000183624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3488  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00137445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3766  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000108255  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1936  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  100 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0337  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000775128  normal  0.0104163 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0286  50S ribosomal protein L14  91.43 
 
 		 369 bp  46.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000002438  normal  0.0225309 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5134  ribosomal protein L14  96.15 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.392255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  96.15 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  93.33 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0766  50S ribosomal protein L14  80.61 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115755  normal  0.0767388 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  93.33 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  96.15 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5060  50S ribosomal protein L14  93.33 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0815516  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10728  50S ribosomal protein L14  93.33 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.440716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  96.15 
 
 		 369 bp  44.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04511  50S ribosomal protein L14  80.61 
 
 		 360 bp  44.1  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00805091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>