More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4709 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 321 aa  646    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  59.43 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  59.87 
 
 		 294 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  59.18 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  60.41 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  56.11 
 
 		 302 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  59.18 
 
 		 301 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  58.13 
 
 		 309 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  61.51 
 
 		 309 aa  352  7e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  56.95 
 
 		 316 aa  348  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  54.6 
 
 		 313 aa  345  8e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  57.04 
 
 		 307 aa  331  9e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  56.11 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  57.14 
 
 		 291 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  50.62 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  56.25 
 
 		 339 aa  315  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  59.45 
 
 		 289 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  50.53 
 
 		 315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  48.22 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  47.34 
 
 		 311 aa  281  7.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  50 
 
 		 298 aa  281  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  48.33 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  45.28 
 
 		 292 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  46.39 
 
 		 301 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  48.8 
 
 		 298 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  51.05 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  49.03 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  49.14 
 
 		 298 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  44.34 
 
 		 292 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  45.98 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  47.83 
 
 		 299 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  43.04 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  46.08 
 
 		 292 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  46.76 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  47.39 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  46.6 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3500  periplasmic solute binding protein  48.99 
 
 		 312 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0623  periplasmic solute binding protein  47.9 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  44.44 
 
 		 292 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  43.59 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  40.37 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  42.56 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  40.33 
 
 		 353 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  34.29 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  34.48 
 
 		 304 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  37.42 
 
 		 306 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  38.01 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  34.11 
 
 		 321 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  33.44 
 
 		 286 aa  192  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  33.76 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  39.93 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  34.37 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  34.56 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  32.81 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  34.56 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  34.56 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  36.57 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  34.38 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  31.86 
 
 		 311 aa  185  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  33.95 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  31.71 
 
 		 311 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  35.06 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.33 
 
 		 313 aa  182  8.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  34.09 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  34.09 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  35.11 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  34.09 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  34.09 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  35.08 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  34.09 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  31.78 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  31.78 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.49 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3452  periplasmic solute binding protein  32.61 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.593558  normal  0.669669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  35.89 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  33.8 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  32.81 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  36.05 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3698  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  31.43 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  31.41 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  35.44 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  33.44 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  31.82 
 
 		 294 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  34.64 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  31.82 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.6 
 
 		 349 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  34.12 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  34.14 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  32.06 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.49 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  33.57 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  32.41 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 		 371 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  34.69 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>