More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4708 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  100 
 
 		 290 aa  547  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  66.9 
 
 		 290 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  65.16 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  66.55 
 
 		 291 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  63.29 
 
 		 290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  65.16 
 
 		 289 aa  350  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  64.46 
 
 		 290 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  64.81 
 
 		 289 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  64.14 
 
 		 291 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  64.26 
 
 		 295 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  64.58 
 
 		 295 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  64.26 
 
 		 295 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  62.24 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  65.34 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  61.28 
 
 		 296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  60.78 
 
 		 288 aa  301  9e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  61.32 
 
 		 288 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  59.03 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  58.33 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  60 
 
 		 300 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  57.39 
 
 		 290 aa  291  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  56.7 
 
 		 291 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  58.62 
 
 		 290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  58.48 
 
 		 290 aa  288  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  59.79 
 
 		 288 aa  285  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  58.97 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  63.29 
 
 		 288 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  53.36 
 
 		 293 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  53.52 
 
 		 299 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  52.11 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  56.79 
 
 		 304 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  57.79 
 
 		 290 aa  267  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  52.78 
 
 		 286 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  51.62 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  53.19 
 
 		 284 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  53.57 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  52.5 
 
 		 284 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  56 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  52.71 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  48.71 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  57.29 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.54 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.68 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.68 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.18 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  31.79 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  31.21 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30 
 
 		 288 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  30.04 
 
 		 289 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  28.42 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.21 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.53 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.53 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  30.82 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.16 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.32 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.32 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  30.4 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.07 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  30.15 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  28.87 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 278 aa  115  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  27.44 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  25.9 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  30.82 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  25.9 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  25.9 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  32.74 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  31.46 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  28.31 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  26.57 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  33.97 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  28.78 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  30.96 
 
 		 289 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.73 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  29.56 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  28.95 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.86 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  29.56 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  28.46 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  32.16 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  32.62 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  26.32 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  28.52 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  29.71 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  26.39 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  29.93 
 
 		 287 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  29.51 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  30.65 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  31.21 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  28.46 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  28.95 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  28.92 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>