More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4704 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 289 aa  601  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  66.08 
 
 		 287 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  68.79 
 
 		 291 aa  421  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  66.78 
 
 		 287 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  66.08 
 
 		 287 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2382  formyltetrahydrofolate deformylase  65.96 
 
 		 285 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2764  formyltetrahydrofolate deformylase  66.67 
 
 		 283 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999032  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  64.34 
 
 		 287 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  62.59 
 
 		 287 aa  394  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  61.89 
 
 		 287 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  64.54 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1157  formyltetrahydrofolate deformylase  67.38 
 
 		 284 aa  391  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.604603  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  61.94 
 
 		 284 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  64.89 
 
 		 283 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2862  formyltetrahydrofolate deformylase  63.03 
 
 		 284 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.413616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1943  formyltetrahydrofolate deformylase  58.95 
 
 		 286 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000066655 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  56.94 
 
 		 293 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  56.06 
 
 		 288 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4206  formyltetrahydrofolate deformylase  56.23 
 
 		 294 aa  335  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5642  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 294 aa  332  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.60464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4496  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 294 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6579  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 294 aa  331  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  normal  0.0500835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  56.25 
 
 		 285 aa  328  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 288 aa  328  8e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  55.63 
 
 		 288 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1458  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6011  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 		 294 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2603  formyltetrahydrofolate deformylase  56.07 
 
 		 294 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2106  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 288 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.815168  normal  0.379054 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 294 aa  324  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 294 aa  324  9e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2830  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 		 294 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.694192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  56.07 
 
 		 284 aa  322  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 282 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1628  formyltetrahydrofolate deformylase  53.66 
 
 		 298 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0459247  normal  0.542854 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0909  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0852  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2971  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 294 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.266607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2376  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 293 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0552536 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  52.78 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  55.28 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 		 287 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  53.93 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  54.58 
 
 		 288 aa  318  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 282 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  54.64 
 
 		 303 aa  318  9e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 307 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2226  formyltetrahydrofolate deformylase  54.33 
 
 		 288 aa  317  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0326176  normal  0.659595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  52.31 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3310  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  55.48 
 
 		 282 aa  316  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  53.82 
 
 		 289 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  50.53 
 
 		 303 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2454  formyltetrahydrofolate deformylase  53.98 
 
 		 288 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2094  formyltetrahydrofolate deformylase  52.96 
 
 		 298 aa  315  5e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0689957  normal  0.0344586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  51.92 
 
 		 288 aa  315  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  54.45 
 
 		 282 aa  315  8e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0411  formyltetrahydrofolate deformylase  53.06 
 
 		 295 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.789305  normal  0.762078 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  53.47 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4812  formyltetrahydrofolate deformylase  54.26 
 
 		 290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0896795  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  56.29 
 
 		 302 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  53.87 
 
 		 286 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  55.32 
 
 		 282 aa  311  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  54.7 
 
 		 287 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  51.36 
 
 		 294 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 297 aa  310  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  51.76 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  52.04 
 
 		 294 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  53.74 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2111  formyltetrahydrofolate deformylase  52.6 
 
 		 301 aa  308  5.9999999999999995e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1188  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 286 aa  308  8e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000131662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  51.02 
 
 		 294 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  51.02 
 
 		 294 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 285 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1837  formyltetrahydrofolate deformylase  50.87 
 
 		 290 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.457824  normal  0.78955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  52.6 
 
 		 287 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0065  formyltetrahydrofolate deformylase  51.85 
 
 		 290 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.957043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2356  formyltetrahydrofolate deformylase  55.52 
 
 		 285 aa  306  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  51.05 
 
 		 283 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0482  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2119  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0839  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0995  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380176  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1968  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0467721  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0751  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.194216  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0699  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 291 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  51.75 
 
 		 282 aa  305  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  52.48 
 
 		 284 aa  305  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5211  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 294 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3294  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 294 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  52.6 
 
 		 287 aa  305  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5074  formyltetrahydrofolate deformylase  51.88 
 
 		 294 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0585  formyltetrahydrofolate deformylase  51.54 
 
 		 294 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  51.19 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  51.19 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1857  formyltetrahydrofolate deformylase  52.56 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.329749  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1575  formyltetrahydrofolate deformylase  52.28 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>