More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4466 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  100 
 
 
419 aa  858  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  69.57 
 
 
415 aa  606  1e-172  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2990  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.93 
 
 
428 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.104458 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.6 
 
 
415 aa  599  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3969  cysteine desulfurase  68.36 
 
 
415 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0413583  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.45 
 
 
414 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  69.55 
 
 
414 aa  583  1e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1661  cysteine desulphurases, SufS  67.23 
 
 
414 aa  582  1e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.278494  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.12 
 
 
415 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0087  SufS subfamily cysteine desulfurase  68.61 
 
 
420 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  66.34 
 
 
413 aa  574  1e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0698  SufS subfamily cysteine desulfurase  67.65 
 
 
414 aa  574  1e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13787  normal  0.199911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.67 
 
 
413 aa  566  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5106  SufS subfamily cysteine desulfurase  66.91 
 
 
413 aa  561  1e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  66.67 
 
 
413 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  65.53 
 
 
418 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.53 
 
 
418 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  63.17 
 
 
414 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  64.73 
 
 
416 aa  548  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  65.76 
 
 
414 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4460  cysteine desulfurase, SufS subfamily  64.42 
 
 
426 aa  544  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.572328  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  64.85 
 
 
414 aa  541  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  64.44 
 
 
413 aa  539  1e-152  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  64.36 
 
 
414 aa  538  1e-152  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.37 
 
 
413 aa  534  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  63.37 
 
 
413 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.11 
 
 
408 aa  505  1e-142  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  54.95 
 
 
414 aa  481  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  54.89 
 
 
422 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1249  cysteine desulfurase  56.54 
 
 
406 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.491768  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.98 
 
 
413 aa  461  1e-128  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2356  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.94 
 
 
406 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0431  putative selenocysteine lyase  55.45 
 
 
406 aa  452  1e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2088  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.2 
 
 
406 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2355  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.17 
 
 
407 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.331891  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  55.25 
 
 
451 aa  445  1e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1623  cysteine desulfurase  53.71 
 
 
406 aa  441  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0344832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3970  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.58 
 
 
403 aa  439  1e-122  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.615432  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.77 
 
 
418 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1608  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.25 
 
 
657 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.5 
 
 
408 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.76 
 
 
412 aa  429  1e-119  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  49.75 
 
 
419 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.05 
 
 
662 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  50.84 
 
 
414 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0728  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.35 
 
 
421 aa  428  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.88575  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.5 
 
 
412 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  3.85676e-08  unclonable  1.52095e-15 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.36 
 
 
444 aa  426  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  49.51 
 
 
420 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2446  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.35 
 
 
407 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  51 
 
 
419 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2748  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  52.1 
 
 
407 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0488866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  50.62 
 
 
420 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.13 
 
 
420 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  2.91669e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50 
 
 
429 aa  421  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  50.88 
 
 
405 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  49.75 
 
 
420 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  53.12 
 
 
421 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.12 
 
 
417 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  52.96 
 
 
417 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.61 
 
 
406 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1815  selenocysteine lyase  52.01 
 
 
665 aa  418  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.653401  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.32 
 
 
414 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
404 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.33 
 
 
429 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1232  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.34 
 
 
629 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153291  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  49.26 
 
 
423 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  50.88 
 
 
405 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.64 
 
 
404 aa  417  1e-115  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.15 
 
 
419 aa  418  1e-115  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  50 
 
 
416 aa  416  1e-115  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3312  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
415 aa  417  1e-115  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0757647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49 
 
 
419 aa  418  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.36 
 
 
406 aa  415  1e-115  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.76 
 
 
419 aa  418  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.51 
 
 
416 aa  416  1e-115  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
418 aa  415  1e-115  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.59 
 
 
441 aa  417  1e-115  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  50.12 
 
 
406 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  50.12 
 
 
406 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  50.62 
 
 
404 aa  414  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.76 
 
 
774 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.96 
 
 
433 aa  411  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  50.12 
 
 
406 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  50.12 
 
 
406 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1427  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.03 
 
 
664 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  7.69952e-06 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.11 
 
 
429 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.6 
 
 
419 aa  412  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2269  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.18 
 
 
414 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.28 
 
 
673 aa  413  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.2 
 
 
411 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.86 
 
 
429 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2183  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
406 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000179204  hitchhiker  2.83455e-05 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.87 
 
 
404 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.78 
 
 
427 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4655  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.76 
 
 
644 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00370812  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5682  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
560 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  49.88 
 
 
406 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  49.88 
 
 
406 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  49.88 
 
 
406 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>