More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4440 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 549 aa  1113    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  58.54 
 
 		 564 aa  639    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  58.3 
 
 		 554 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  57.45 
 
 		 571 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  44.49 
 
 		 566 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  44.23 
 
 		 569 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.01 
 
 		 582 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.01 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.01 
 
 		 563 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.82 
 
 		 563 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.01 
 
 		 563 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.01 
 
 		 563 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.01 
 
 		 561 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.01 
 
 		 582 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.82 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.41 
 
 		 561 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 		 565 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.6 
 
 		 561 aa  433  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  42.3 
 
 		 557 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  42.14 
 
 		 559 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.18 
 
 		 585 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  41.74 
 
 		 564 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  42.99 
 
 		 583 aa  432  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  45.73 
 
 		 549 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  41.65 
 
 		 551 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  41.82 
 
 		 578 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 539 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  43.19 
 
 		 590 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0169  AMP-dependent synthetase and ligase  46.04 
 
 		 554 aa  415  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.38937  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 		 584 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  40.44 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  42.42 
 
 		 591 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  43.63 
 
 		 543 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 573 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  41.53 
 
 		 561 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7073  putative pimeloyl-CoA ligase pimA  41.87 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0254  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0249162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  40.72 
 
 		 577 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  41.93 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 585 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4237  dicarboxylate/CoA ligase PimA  40.93 
 
 		 552 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3552  AMP-dependent synthetase and ligase  41.84 
 
 		 550 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 		 577 aa  384  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  40.93 
 
 		 561 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  41.37 
 
 		 564 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 		 583 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  40.95 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41 
 
 		 566 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 579 aa  368  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0138  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.19 
 
 		 566 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.938727  normal  0.187232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 551 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 544 aa  359  6e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2791  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 575 aa  357  3.9999999999999996e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.444002 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.22 
 
 		 554 aa  356  6.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.04 
 
 		 566 aa  356  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.85 
 
 		 581 aa  353  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.08 
 
 		 510 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  39.3 
 
 		 565 aa  352  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.08 
 
 		 510 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39 
 
 		 566 aa  352  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.08 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.78 
 
 		 581 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.08 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.73 
 
 		 583 aa  350  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 		 510 aa  350  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.62 
 
 		 510 aa  349  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  38.59 
 
 		 560 aa  349  9e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 		 510 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.81 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.89 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1416  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 584 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.498039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1456  AMP-dependent synthetase and ligase  39.34 
 
 		 584 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.877669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 584 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1534  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 584 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 		 584 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 		 521 aa  344  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4674  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 		 584 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0112629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  39.78 
 
 		 584 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.56 
 
 		 560 aa  343  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.67 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.35 
 
 		 561 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 512 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.86 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.23 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 553 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0143852  hitchhiker  0.00793845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.77 
 
 		 557 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.77 
 
 		 557 aa  340  5e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.77 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.86 
 
 		 557 aa  339  9e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.12 
 
 		 557 aa  339  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.86 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.86 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.7 
 
 		 577 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.73 
 
 		 572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.67 
 
 		 557 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.7 
 
 		 562 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>