More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4434 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
270 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2519  phosphatidate cytidylyltransferase  44.69 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  48.16 
 
 
278 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  48.16 
 
 
270 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1136  phosphatidate cytidylyltransferase  46 
 
 
277 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1781  phosphatidate cytidylyltransferase  45.74 
 
 
276 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.743634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  46.77 
 
 
285 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  43.49 
 
 
282 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0298  phosphatidate cytidylyltransferase  42.75 
 
 
296 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0486907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2823  phosphatidate cytidylyltransferase  42.16 
 
 
282 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  42.65 
 
 
300 aa  158  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00786591 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0587  phosphatidate cytidylyltransferase  40.67 
 
 
272 aa  158  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.254571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1588  phosphatidate cytidylyltransferase  45.59 
 
 
276 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540803  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  46.47 
 
 
270 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  46.18 
 
 
286 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  46.25 
 
 
294 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1854  phosphatidate cytidylyltransferase  42.25 
 
 
280 aa  149  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0937  normal  0.0629717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  45.66 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  46.04 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1699  phosphatidate cytidylyltransferase  40.47 
 
 
280 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0556824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
289 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2441  phosphatidate cytidylyltransferase  42.91 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.240167  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0634  phosphatidate cytidylyltransferase  46.99 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119323  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  45.49 
 
 
268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2556  phosphatidate cytidylyltransferase  46.03 
 
 
229 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1365  phosphatidate cytidylyltransferase  39.71 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.0127657 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2708  phosphatidate cytidylyltransferase  40.81 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  40 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  53.25 
 
 
285 aa  125  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1846  phosphatidate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
280 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000959931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0368  phosphatidate cytidylyltransferase  42.51 
 
 
294 aa  123  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.085033  normal  0.21043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0465  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
268 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.08 
 
 
271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0806  CDP-diglyceride synthetase  50 
 
 
263 aa  116  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000346941  hitchhiker  0.0000000545456 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  46.15 
 
 
216 aa  115  6e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  35.66 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  52.83 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  50.42 
 
 
265 aa  112  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1385  phosphatidate cytidylyltransferase  39.69 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.652196  normal  0.0315124 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1496  phosphatidate cytidylyltransferase  52.63 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.28827  normal  0.939207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0982  phosphatidate cytidylyltransferase  35.04 
 
 
287 aa  109  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.375192  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3191  phosphatidate cytidylyltransferase  54.48 
 
 
287 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  47.06 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  32.35 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  31.13 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
211 aa  108  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2173  phosphatidate cytidylyltransferase  37.92 
 
 
273 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
271 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1955  phosphatidate cytidylyltransferase  48.74 
 
 
221 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.388381  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  48.28 
 
 
264 aa  106  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
271 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  37.35 
 
 
271 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  35.66 
 
 
268 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
277 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 
260 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  43.55 
 
 
260 aa  105  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  35.8 
 
 
271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 
263 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2543  phosphatidate cytidylyltransferase  34.57 
 
 
281 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1858  phosphatidate cytidylyltransferase  38.26 
 
 
276 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.502939  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  34.94 
 
 
271 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2456  phosphatidate cytidylyltransferase  36.58 
 
 
283 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404138 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  39.26 
 
 
208 aa  102  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3563  phosphatidate cytidylyltransferase  34.11 
 
 
263 aa  102  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  44.92 
 
 
260 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.81 
 
 
280 aa  102  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
263 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
271 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3920  phosphatidate cytidylyltransferase  33.72 
 
 
263 aa  102  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.624348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  47.15 
 
 
264 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  46.97 
 
 
271 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  45.11 
 
 
265 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  47.11 
 
 
264 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  28.99 
 
 
280 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1324  phosphatidate cytidylyltransferase  48.21 
 
 
255 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517049  hitchhiker  0.0000000000253946 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  42.42 
 
 
242 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  33.66 
 
 
272 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2038  phosphatidate cytidylyltransferase  47.46 
 
 
264 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  48.06 
 
 
273 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1747  phosphatidate cytidylyltransferase  41.34 
 
 
276 aa  99.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  49.52 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3673  phosphatidate cytidylyltransferase  34.11 
 
 
263 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3581  phosphatidate cytidylyltransferase  34.11 
 
 
263 aa  99  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3960  phosphatidate cytidylyltransferase  34.11 
 
 
263 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  45.45 
 
 
259 aa  99  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0613  phosphatidate cytidylyltransferase  36.7 
 
 
272 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  33.2 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3834  phosphatidate cytidylyltransferase  34.11 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.93186e-62 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
341 aa  97.8  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1540  phosphatidate cytidylyltransferase  37.12 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  41.83 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44.53 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  41.38 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2381  phosphatidate cytidylyltransferase  46.67 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
233 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  49.58 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>