186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4343 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
193 aa  377  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.45 
 
 
194 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.79 
 
 
197 aa  194  7e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.16 
 
 
193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.92 
 
 
196 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.74 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.15 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.21 
 
 
197 aa  167  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.79 
 
 
192 aa  151  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.64 
 
 
195 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.27 
 
 
193 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.82 
 
 
192 aa  129  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.08 
 
 
507 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.58 
 
 
191 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.21 
 
 
205 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.9 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 
204 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  35.08 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  33.33 
 
 
192 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.77 
 
 
192 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 
192 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  35.45 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.11 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.6 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.98 
 
 
197 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.76 
 
 
216 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.17 
 
 
507 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.39 
 
 
193 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  33.86 
 
 
207 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.02 
 
 
191 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.26 
 
 
191 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  33.33 
 
 
207 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.23 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.23 
 
 
191 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.72 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.72 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  28.72 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 
233 aa  94  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.72 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  28.72 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.18 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.6 
 
 
218 aa  87  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000199345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 
189 aa  85.1  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.27 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  22.22 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  25.13 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.09 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.84 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.17 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.25 
 
 
198 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.08 
 
 
193 aa  61.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.69 
 
 
259 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0470076  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  23.08 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.59 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.69 
 
 
259 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  32.69 
 
 
259 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  23.59 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  23.44 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.65 
 
 
197 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  23.59 
 
 
193 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  30.93 
 
 
203 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  23.59 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3903  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 
258 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.96153 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  23.59 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4017  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  32.26 
 
 
258 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.117199  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3208  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.24 
 
 
272 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.485932 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  23.35 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6287  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.92 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.84 
 
 
206 aa  57.8  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.55 
 
 
261 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48440  putative NAD(P)H dehydrogenase  30.9 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154354  normal  0.129613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.89 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  23.59 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.13 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  23.78 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17880  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.86 
 
 
264 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.615091  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.06 
 
 
195 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1088  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.68 
 
 
261 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.05 
 
 
261 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  21.35 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2777  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.79 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  26.28 
 
 
213 aa  54.7  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.26 
 
 
196 aa  54.7  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.08 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000846124  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  28.97 
 
 
209 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.8 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3066  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.31 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  22.87 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000456035  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  29.03 
 
 
261 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2450  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.34 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  0.966087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.49 
 
 
262 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  30.77 
 
 
259 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2859  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.55 
 
 
290 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4668  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.84 
 
 
193 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2033  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.29 
 
 
195 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  29.68 
 
 
290 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>