244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4337 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4337  LrgB family protein  100 
 
 		 231 aa  450  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.4746  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0422  LrgB family protein  63.72 
 
 		 231 aa  288  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0342  hypothetical protein  64.19 
 
 		 235 aa  286  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0326  hypothetical protein  63.76 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.568511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7210  putative murein hydrolase export regulator, LrgB family protein  61.84 
 
 		 236 aa  271  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.879392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0267  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0272  hypothetical protein  59.55 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19690  hypothetical protein  53.88 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1695  hypothetical protein  53.42 
 
 		 228 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3796  LrgB family protein  65.18 
 
 		 240 aa  234  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0900  LrgB-like protein  54.3 
 
 		 228 aa  224  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4609  LrgB family protein  52.94 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4625  LrgB family protein  54.11 
 
 		 228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4485  LrgB family protein  54.11 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2920  LrgB family protein  49.77 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0034  LrgB family protein  49.11 
 
 		 240 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306981  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0082  LrgB-like protein  48.74 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.18459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0043  LrgB family protein  49.11 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.690541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0061  LrgB family protein  48.66 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.775871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0045  LrgB family protein  49.11 
 
 		 240 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0028  LrgB-like protein  48.66 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0042  LrgB family protein  48.66 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0089  LrgB family protein  47.74 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0099  LrgB family protein  47.74 
 
 		 224 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4427  LrgB family protein  45.36 
 
 		 229 aa  174  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.113499  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3226  LrgB-like protein  48.21 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.144978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0819  LrgB family protein  42.79 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.061161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4616  LrgB family protein  41.67 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0025  hypothetical protein  52.75 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216066  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4532  lrgB-like family protein  41.67 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.889737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4618  LrgB family protein  41.67 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4525  LrgB family protein  41.67 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0027  LrgB-like family protein  49.57 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2767  hypothetical protein  52.75 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3499  hypothetical protein  52.75 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1870  hypothetical protein  52.75 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0026  LrgB-like family protein  52.75 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23092  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2682  hypothetical protein  52.75 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0238  hypothetical protein  52.75 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6539  LrgB family protein  44.98 
 
 		 226 aa  167  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.198287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1686  hypothetical protein  46.83 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000795605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4667  LrgB family protein  41.2 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.598523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1607  LrgB-like protein  42.22 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.884781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0273  LrgB family protein  40 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1322  LrgB family protein  40.67 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0923  LrgB family protein  43.93 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.47828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0886  LrgB family protein  43.93 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00106123  normal  0.143935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1048  hypothetical protein  44.44 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0955  LrgB family protein  43.12 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0990  LrgB family protein  43.12 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0976  LrgB family protein  43.12 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3049  LrgB family protein  43.46 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00126242  normal  0.0295055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0245  LrgB family protein  43.72 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3388  LrgB family protein  43.12 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0830  LrgB family protein  41.67 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3749  LrgB family protein  41.07 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2322  LrgB family protein  37.44 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000117788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3024  LrgB family protein  42.45 
 
 		 239 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3356  LrgB family protein  37.86 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3711  hypothetical protein  37.86 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.34067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1536  hypothetical protein  37.86 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.020516 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3778  hypothetical protein  37.86 
 
 		 225 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3704  hypothetical protein  37.38 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7636  LrgB-like protein  40.38 
 
 		 244 aa  141  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3376  murein hydrolase export regulator  37.38 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.508194  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3687  hypothetical protein  37.38 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3459  hypothetical protein  37.38 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.807619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3425  murein hydrolase export regulator  37.38 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0481029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3731  hypothetical protein  37.38 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6075  LrgB family protein  39.91 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6059  LrgB family protein  39.44 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.742566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5839  LrgB family protein  39.91 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0892  LrgB family protein  42.79 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3676  LrgB family protein  34.55 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000265737  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3274  hypothetical protein  36.61 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.640575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2745  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6615  LrgB family protein  43.1 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.918495  normal  0.128036 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6133  LrgB family protein  43.1 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7753  normal  0.649123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02071  predicted inner membrane protein  36.94 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1516  LrgB family protein  36.94 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0829  hypothetical protein  36.94 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2437  hypothetical protein  36.94 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02030  hypothetical protein  36.94 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1506  hypothetical protein  36.94 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2289  hypothetical protein  36.94 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561985 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1204  LrgB-like protein  37.61 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0574065  normal  0.106071 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1415  LrgB family protein  33.33 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.429931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3064  LrgB family protein  40 
 
 		 245 aa  134  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.881696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0021  LrgB family protein  32.3 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5235  hypothetical protein  36.41 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2926  hypothetical protein  42.65 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000884331  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4924  LrgB family protein  35.94 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4959  murein hydrolase export regulator  36.41 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0594327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4811  murein hydrolase export regulator  36.41 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.977744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5706  hypothetical protein  36.41 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0302035  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4821  murein hydrolase export regulator  36.41 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0719494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5217  hypothetical protein  36.41 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5337  hypothetical protein  36.41 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.247434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5345  LrgB family protein  42.13 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.426431 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5281  hypothetical protein  36.41 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>