More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4330 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  100 
 
 
273 aa  550  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  66.67 
 
 
262 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  67.84 
 
 
263 aa  348  7e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  66.67 
 
 
263 aa  346  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  64.31 
 
 
259 aa  345  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  65.88 
 
 
265 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  68.63 
 
 
263 aa  338  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  65.1 
 
 
264 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1584  TatD family hydrolase  67.84 
 
 
264 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2718  TatD-related deoxyribonuclease  63.53 
 
 
263 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.13665  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0996  TatD family hydrolase  63.53 
 
 
263 aa  333  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0963  TatD family hydrolase  63.53 
 
 
263 aa  333  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  61.18 
 
 
268 aa  332  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  62.89 
 
 
260 aa  330  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  60.94 
 
 
260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  61.96 
 
 
271 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6467  TatD family hydrolase  64.31 
 
 
270 aa  324  9e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.618077  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  62.35 
 
 
263 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  61.18 
 
 
268 aa  315  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  60 
 
 
267 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  59.22 
 
 
270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  54.86 
 
 
257 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4702  hydrolase, TatD family  58.37 
 
 
265 aa  286  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4186  TatD family hydrolase  57.14 
 
 
265 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1515  TatD family hydrolase  56.59 
 
 
266 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4557  hydrolase, TatD family  56.76 
 
 
265 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  54.75 
 
 
265 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2329  TatD family hydrolase  54.75 
 
 
265 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.493356  normal  0.509317 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  55.86 
 
 
265 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1275  TatD-related deoxyribonuclease  54.05 
 
 
267 aa  275  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  52.94 
 
 
267 aa  273  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0906  TatD family hydrolase  54.26 
 
 
257 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.206008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0487  TatD family hydrolase  52.73 
 
 
258 aa  271  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.896623 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0920  hydrolase  56.92 
 
 
269 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0555  TatD family hydrolase  56.86 
 
 
265 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  57.14 
 
 
228 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1260  TatD-related deoxyribonuclease  50 
 
 
258 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0762815  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  50.78 
 
 
259 aa  262  4e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2697  TatD family hydrolase  48.63 
 
 
264 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190817  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1452  Sec-independent protein translocase TatD  49.22 
 
 
260 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.350253  hitchhiker  0.000933901 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  55.73 
 
 
263 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  50.95 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0793  TatD family hydrolase  46.09 
 
 
260 aa  248  8e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  50.19 
 
 
257 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  49.24 
 
 
267 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  49.62 
 
 
267 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  48.06 
 
 
265 aa  238  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  48.86 
 
 
267 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  46.9 
 
 
265 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4149  TatD-like deoxyribonuclease  49.62 
 
 
261 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1120  TatD family deoxyribonuclease  46.88 
 
 
255 aa  235  8e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0283  TatD-related deoxyribonuclease  44.83 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.327553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  48.41 
 
 
459 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  47.41 
 
 
269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2040  TatD family hydrolase  46.72 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231203  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  47.29 
 
 
258 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  44.4 
 
 
261 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15000  hydrolase, TatD-family  49.81 
 
 
261 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  46.69 
 
 
254 aa  228  7e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  48.89 
 
 
261 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  47.08 
 
 
258 aa  225  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  47.39 
 
 
261 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  48.83 
 
 
257 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  48.83 
 
 
257 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  45.14 
 
 
259 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1914  TatD family hydrolase  47.15 
 
 
259 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.537601  normal  0.0273018 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  48.45 
 
 
262 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  46.62 
 
 
260 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6188  TatD-related deoxyribonuclease  47.15 
 
 
259 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1891  TatD family hydrolase  47.15 
 
 
259 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  46.62 
 
 
260 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  41.9 
 
 
257 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  46.15 
 
 
262 aa  222  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1985  TatD family hydrolase  45.98 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0122844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1383  TatD family hydrolase  47.15 
 
 
259 aa  222  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  46.24 
 
 
260 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  46.62 
 
 
260 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  41.92 
 
 
258 aa  221  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  41.02 
 
 
255 aa  221  8e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  45.38 
 
 
262 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5191  TatD-related deoxyribonuclease  46.77 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1720  TatD family hydrolase  47.19 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149268 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  40.62 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  44.23 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2610  TatD family hydrolase  44.79 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1951  TatD family hydrolase  45.39 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.974575 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2258  TatD-related deoxyribonuclease  45.59 
 
 
264 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1828  TatD family hydrolase  46.42 
 
 
260 aa  219  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  48.11 
 
 
258 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  45 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1913  TatD family hydrolase  45.83 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1422  TatD family hydrolase  45.83 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2439  hypothetical protein  45.83 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.86869  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2278  TatD family hydrolase  45.83 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1800  TatD family hydrolase  46.59 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.907271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  45 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2317  TatD family hydrolase  45.83 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1186  TatD family hydrolase  45.83 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3391  TatD family hydrolase  45.83 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  45 
 
 
283 aa  218  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>