289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4308 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 115 aa  226  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  66.67 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  63.96 
 
 		 144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  64.49 
 
 		 133 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2187  preprotein translocase, YajC subunit  65.14 
 
 		 111 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.548502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  65.18 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4229  preprotein translocase, YajC subunit  65.74 
 
 		 110 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4599  preprotein translocase, YajC subunit  65.74 
 
 		 110 aa  140  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0858963  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  58.56 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  58.18 
 
 		 110 aa  137  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2778  preprotein translocase, YajC subunit  62.73 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414643  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  57.66 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2733  preprotein translocase, YajC subunit  62.73 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  56.76 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  62.93 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2490  preprotein translocase, YajC subunit  65.14 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  60.36 
 
 		 111 aa  130  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  63.72 
 
 		 114 aa  130  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  55.77 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  54.7 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4748  preprotein translocase, YajC subunit  62.92 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0608539 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  49.11 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  57.95 
 
 		 93 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2275  preprotein translocase, YajC subunit  62.86 
 
 		 110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1797  protein translocase subunit yajC  54.05 
 
 		 111 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.422373  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  54.84 
 
 		 94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  51.02 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  59.04 
 
 		 105 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2659  preprotein tranlocase protein  49.51 
 
 		 123 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32408  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1693  preprotein translocase, YajC subunit  55.56 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  51.85 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  51.85 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  52.33 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  48.67 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  42.37 
 
 		 126 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  46.61 
 
 		 133 aa  94.4  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  46.08 
 
 		 102 aa  94  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  42.31 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  43.27 
 
 		 107 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  50.6 
 
 		 110 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  45.71 
 
 		 109 aa  87  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  40.19 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  44.34 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  44.94 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  45.35 
 
 		 113 aa  84.3  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  39.42 
 
 		 108 aa  83.6  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  40.2 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  38.53 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  41.11 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2701  preprotein translocase subunit YajC  37.96 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00115009  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 108 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  44.34 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2891  preprotein translocase subunit YajC  37.61 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0845715  hitchhiker  0.000439753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2881  preprotein translocase subunit YajC  36.7 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2786  preprotein translocase subunit YajC  36.7 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000416487  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1571  preprotein translocase subunit YajC  36.7 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000298712  hitchhiker  0.0000000623922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  42.22 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2806  preprotein translocase subunit YajC  36.7 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000242137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1062  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.9983  hitchhiker  0.00140347 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.35 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  45.88 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1715  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0876  preprotein translocase subunit YajC  41.9 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3112  preprotein translocase subunit YajC  37.04 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  39.42 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  42.45 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  40.57 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1383  preprotein translocase subunit YajC  36.7 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000313492  hitchhiker  0.00000720992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  41.35 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1471  preprotein translocase subunit YajC  37.61 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000169079  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  41.67 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  46.84 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3096  preprotein translocase, YajC subunit  43.96 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0763389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  43.53 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3122  preprotein translocase subunit YajC  40.57 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00795341  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3383  preprotein translocase subunit YajC  40.57 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000227784  normal  0.514524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  41.35 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3263  preprotein translocase subunit YajC  40.57 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000145315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3226  preprotein translocase subunit YajC  40.95 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000105955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  35.58 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0477  preprotein translocase subunit YajC  40.95 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>