More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4294 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  100 
 
 		 425 aa  842    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  58.79 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  50.51 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  57.54 
 
 		 413 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  51.86 
 
 		 415 aa  363  3e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  51.01 
 
 		 399 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  53.73 
 
 		 422 aa  355  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  51.77 
 
 		 415 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  48.77 
 
 		 421 aa  348  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  49.74 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  50.13 
 
 		 416 aa  338  8e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  47.97 
 
 		 415 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  51.15 
 
 		 412 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  51.41 
 
 		 399 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  51.41 
 
 		 399 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  47.16 
 
 		 398 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  50 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  48.26 
 
 		 409 aa  329  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  48.74 
 
 		 412 aa  326  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  47.33 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  47.52 
 
 		 415 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  48.31 
 
 		 423 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  48.49 
 
 		 398 aa  315  9e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  43.42 
 
 		 403 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.85 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  44.42 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  43.42 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  43.18 
 
 		 403 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  39.5 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  40.9 
 
 		 402 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.3 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  38.56 
 
 		 403 aa  275  8e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  43.75 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  38.48 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  36.66 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  39.02 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 401 aa  266  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 401 aa  266  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35.98 
 
 		 404 aa  262  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  38.73 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 403 aa  259  8e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  40.92 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  42.36 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  39.65 
 
 		 537 aa  256  6e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  38.97 
 
 		 395 aa  252  9.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  40.41 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  43.05 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  41.15 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 401 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.2 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  39.15 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  43.54 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  39.33 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  40.66 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  41.21 
 
 		 404 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  39.05 
 
 		 403 aa  233  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  39.65 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  39.02 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  37.17 
 
 		 479 aa  231  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  39.61 
 
 		 411 aa  231  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  41.15 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 403 aa  230  5e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  42.78 
 
 		 412 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  38.31 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  40.8 
 
 		 407 aa  227  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  39.6 
 
 		 403 aa  226  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  41.94 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  40.77 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 408 aa  222  9e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  41.51 
 
 		 406 aa  222  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  40.29 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  39.75 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  40.26 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  35.91 
 
 		 402 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  37.97 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  38.5 
 
 		 402 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 403 aa  216  9e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  40.55 
 
 		 408 aa  215  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  39.6 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.62 
 
 		 514 aa  213  7e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 410 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  44.94 
 
 		 358 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  38.24 
 
 		 507 aa  210  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  39.36 
 
 		 410 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  39.3 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  36.74 
 
 		 408 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  35.92 
 
 		 507 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  39.49 
 
 		 408 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.47 
 
 		 526 aa  206  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  35.62 
 
 		 503 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>