132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4159 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4159  urease accessory protein UreF  100 
 
 
309 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3239  Urease accessory protein UreF  61.88 
 
 
238 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2866  urease accessory protein UreF  65 
 
 
229 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal  0.213531 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3014  urease accessory protein UreF  61.88 
 
 
244 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347135  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3203  Urease accessory protein UreF  60.09 
 
 
224 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1092  Urease accessory protein UreF  65.45 
 
 
239 aa  232  8e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.827823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2120  urease accessory protein UreF  65 
 
 
250 aa  229  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3497  urease accessory protein UreF  55.95 
 
 
288 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1868  urease accessory protein UreF  53.74 
 
 
237 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.113809  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  51.52 
 
 
240 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  51.83 
 
 
241 aa  212  8e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4179  Urease accessory protein UreF  51.54 
 
 
240 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  45.58 
 
 
231 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  47.11 
 
 
225 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  44.14 
 
 
228 aa  156  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2009  Urease accessory protein UreF  47.3 
 
 
231 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3260  urease accessory protein UreF  46.02 
 
 
228 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0381  urease accessory protein UreF  43.64 
 
 
214 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11359  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3303  Urease accessory protein UreF  45.5 
 
 
223 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.31623 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0303  urease accessory protein UreF  45.37 
 
 
210 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  45.58 
 
 
228 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1947  urease accessory protein UreF  45.37 
 
 
210 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0218708  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  45.13 
 
 
232 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0991  urease accessory protein UreF  41.41 
 
 
210 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2378  urease accessory protein UreF  42.34 
 
 
223 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3047  Urease accessory protein UreF  45.5 
 
 
223 aa  135  7e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159294  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3469  urease accessory protein  43.48 
 
 
230 aa  131  1e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2362  putative urease accessory protein  41.36 
 
 
210 aa  129  8e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.875021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2686  urease accessory protein UreF  41.26 
 
 
223 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4247  Urease accessory protein UreF  40.09 
 
 
223 aa  119  5e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1425  urease accessory protein UreF  40.09 
 
 
228 aa  117  2e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3407  urease accessory protein UreF  36.36 
 
 
225 aa  114  2e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.195199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1348  urease accessory protein UreF  35.9 
 
 
233 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4635  urease accessory protein UreF  32.86 
 
 
229 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00483851  normal  0.066113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2303  urease accessory protein UreF  36.61 
 
 
230 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3532  urease accessory protein UreF  36.17 
 
 
251 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510813  normal  0.516432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1755  urease accessory protein UreF  38.01 
 
 
220 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0665  urease accessory protein UreF  34.56 
 
 
224 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675417  normal  0.0233838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3941  Urease accessory protein UreF  37.9 
 
 
259 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.552118  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0972  urease accessory protein UreF  35.71 
 
 
232 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  33.64 
 
 
224 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1243  urease accessory protein UreF  33.49 
 
 
226 aa  99.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2439  urease accessory protein UreF  31.98 
 
 
227 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.280457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1765  urease accessory protein UreF  30.7 
 
 
227 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.858852  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4910  urease accessory protein UreF  33.18 
 
 
224 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3106  Urease accessory protein UreF  32.42 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0186  urease accessory protein UreF  33.48 
 
 
228 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0884  urease accessory protein UreF  31.88 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.782823  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1206  urease accessory protein UreF  40.45 
 
 
215 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  34.07 
 
 
224 aa  92.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2267  Urease accessory protein UreF  32.7 
 
 
227 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  31.88 
 
 
228 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0223  urease accessory protein UreF  30.94 
 
 
221 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2030  urease accessory protein UreF  36.41 
 
 
229 aa  89.4  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.859598  normal  0.139287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0664  urease accessory protein  39.13 
 
 
237 aa  89.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1494  urease accessory protein UreF  33.04 
 
 
236 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36478  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1070  urease accessory protein UreF  34.8 
 
 
250 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0868  urease accessory protein UreF  37.39 
 
 
226 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.947799  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0997  urease accessory protein UreF  31.91 
 
 
230 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.371175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1724  urease accessory protein UreF  31.2 
 
 
288 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616016  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0898  urease accessory protein UreF  37.39 
 
 
226 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4737  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0419  urease accessory protein UreF  37.39 
 
 
226 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.885315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09390  Urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
224 aa  86.7  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0245  urease accessory protein UreF  31.16 
 
 
225 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0788  urease accessory protein UreF  35.14 
 
 
226 aa  84.3  2e-15  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1191  urease accessory protein UreF  28.51 
 
 
230 aa  84.7  2e-15  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  30.88 
 
 
224 aa  83.2  5e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2991  urease accessory protein UreF  30.13 
 
 
231 aa  83.2  5e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.901747  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2420  urease accessory protein UreF  33.93 
 
 
224 aa  83.2  6e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0454768  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3696  putative urease accessory protein UreF  33.8 
 
 
226 aa  82.8  6e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.378168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  26.76 
 
 
232 aa  82.4  8e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2996  urease accessory protein UreF  29.17 
 
 
232 aa  82  1e-14  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1180  urease accessory protein UreF  33.33 
 
 
238 aa  82  1e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.801104  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  25.58 
 
 
228 aa  82  1e-14  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0777  urease accessory protein UreF  34.4 
 
 
226 aa  82.4  1e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  25.55 
 
 
240 aa  81.3  2e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0963  urease accessory protein UreF  31.91 
 
 
230 aa  81.3  2e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0374203 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2182  Urease accessory protein UreF  34.38 
 
 
229 aa  80.1  4e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349664  normal  0.124246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1325  UreF  31.88 
 
 
224 aa  80.1  4e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4004  urease accessory protein UreF  34.7 
 
 
226 aa  79.7  5e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0926  Urease accessory protein UreF  34.26 
 
 
226 aa  79.7  5e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2492  urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
226 aa  79.7  6e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0958  urease accessory protein UreF  26.85 
 
 
230 aa  78.2  1e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2262  urease accessory protein UreF  33.02 
 
 
226 aa  77.4  3e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.998709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64660  urease accessory protein UreF  34.25 
 
 
223 aa  76.3  7e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0385936  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2841  urease accessory protein UreF  31.92 
 
 
224 aa  75.9  8e-13  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0394  Urease accessory protein UreF  29.91 
 
 
227 aa  75.9  9e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2848  urease accessory protein UreF  31.46 
 
 
224 aa  75.1  1e-12  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3078  urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
236 aa  74.3  2e-12  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2059  urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
236 aa  74.3  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.917688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00891  Urease accessory protein UreF  27.57 
 
 
208 aa  74.7  2e-12  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.42714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3114  urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
236 aa  74.3  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3137  urease accessory protein  33.94 
 
 
236 aa  74.3  2e-12  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5615  urease accessory protein UreF  34.25 
 
 
223 aa  74.3  2e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2186  urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
226 aa  74.3  2e-12  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0721  urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
236 aa  74.3  2e-12  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2555  urease accessory protein UreF  33.94 
 
 
226 aa  74.3  2e-12  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1859  Urease accessory protein UreF  33.63 
 
 
229 aa  73.6  4e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.148323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  26.98 
 
 
232 aa  72.4  8e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  25.46 
 
 
240 aa  70.9  3e-11  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>