More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4126 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4126  glyoxylate reductase  100 
 
 
333 aa  672  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23218  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0454  Glyoxylate reductase  79.52 
 
 
334 aa  541  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.15119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0491  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  79.52 
 
 
334 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.159466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0421  glyoxylate reductase  79.52 
 
 
334 aa  541  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2688  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  77.84 
 
 
332 aa  537  1e-152  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0511  glyoxylate reductase  78.08 
 
 
331 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.503847  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2232  glyoxylate reductase  78.08 
 
 
334 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770624  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0378  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  77.71 
 
 
334 aa  527  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0217  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  76.81 
 
 
333 aa  524  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.660632  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  75.9 
 
 
333 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0073  putative glyoxylate reductase  76.44 
 
 
333 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.692518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0616  glycolate reductase  76.2 
 
 
333 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.164009  normal  0.739165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2485  Glyoxylate reductase  75.68 
 
 
331 aa  518  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3943  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  74.02 
 
 
333 aa  518  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3380  glyoxylate reductase  74.77 
 
 
357 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254511  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0354  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  75.3 
 
 
333 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0045  glycolate reductase  75.6 
 
 
333 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0037  2-hydroxyacid dehydrogenase  74.7 
 
 
333 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.256698 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0734  glyoxylate reductase  72.87 
 
 
334 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4409  Glyoxylate reductase  72.34 
 
 
333 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2177  2-hydroxyacid dehydrogenase  72.56 
 
 
334 aa  507  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4089  Glyoxylate reductase  72.04 
 
 
333 aa  507  1e-142  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2089  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  72.26 
 
 
360 aa  505  1e-142  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0314  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenases family protein  71.12 
 
 
334 aa  501  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.907206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3643  glyoxylate reductase  71.77 
 
 
330 aa  488  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.07425e-10 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5058  glyoxylate reductase  72.07 
 
 
328 aa  488  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3790  glycolate reductase  73.87 
 
 
328 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2970  glyoxylate reductase  67.79 
 
 
328 aa  452  1e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0480  glycolate reductase  66.37 
 
 
328 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.330194  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0915  glycolate reductase  65.03 
 
 
328 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1941  glyoxylate reductase  67.67 
 
 
336 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0819733  decreased coverage  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2187  glyoxylate reductase  67.48 
 
 
328 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521168  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0987  glyoxylate reductase  66.87 
 
 
328 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2313  2-hydroxyacid dehydrogenase  66.87 
 
 
328 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0778  glycolate reductase  59.82 
 
 
332 aa  386  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2308  glycolate reductase  54.22 
 
 
339 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4583  glyoxylate reductase  58.59 
 
 
332 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1407  2-hydroxyacid dehydrogenase  44.62 
 
 
323 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2390  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.41 
 
 
324 aa  266  3e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.129625 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1147  glyoxylate reductase  43.61 
 
 
317 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1815  glycolate reductase  45.4 
 
 
323 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.802319  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3322  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  44.17 
 
 
323 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1872  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  45.03 
 
 
319 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2807  glyoxylate reductase  44.79 
 
 
321 aa  253  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.949498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1522  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  42.59 
 
 
320 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.417299  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3914  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.63 
 
 
327 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.430325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0089  Glyoxylate reductase  43.53 
 
 
319 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2820  Glyoxylate reductase  40.3 
 
 
334 aa  242  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.66306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21840  glycerate dehydrogenase  46.21 
 
 
274 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0628061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0619  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding protein  43.12 
 
 
327 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2897  Glyoxylate reductase  42.72 
 
 
327 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000351696  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2082  putative glyoxylate reductase  42.46 
 
 
311 aa  236  5e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1344  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.06 
 
 
338 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.16966e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0731  Glyoxylate reductase  42.19 
 
 
322 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3042  Glyoxylate reductase  43.96 
 
 
324 aa  228  9e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0052  Glyoxylate reductase  42.38 
 
 
316 aa  228  1e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12970  lactate dehydrogenase-like oxidoreductase  44.48 
 
 
321 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0823  glyoxylate reductase  40.87 
 
 
339 aa  227  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5902  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, catalytic region:D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.75 
 
 
327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0476763  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2536  Glyoxylate reductase  42.72 
 
 
318 aa  226  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.400778  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1954  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.87 
 
 
329 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0249135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3049  Glyoxylate reductase  40.43 
 
 
322 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0350  Glyoxylate reductase  41.72 
 
 
319 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3073  Glyoxylate reductase  40.12 
 
 
322 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0551614  normal  0.953247 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0892  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  42.68 
 
 
318 aa  220  2e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0266088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2388  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.94 
 
 
323 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00285003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2029  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  40.73 
 
 
331 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.658247 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0025  lactate dehydrogenase related enzyme  37.07 
 
 
319 aa  217  3e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5114  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.75 
 
 
323 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0592  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  36.78 
 
 
326 aa  216  5e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.80162  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3326  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.57 
 
 
316 aa  216  6e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.428897 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0476  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  44.14 
 
 
319 aa  214  1e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2196  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.49 
 
 
316 aa  213  3e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00601884  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5009  Glyoxylate reductase  44.65 
 
 
345 aa  213  4e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2957  Glyoxylate reductase  39.21 
 
 
320 aa  213  5e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  8.53458e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0256  glyoxylate reductase  41.38 
 
 
315 aa  212  7e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.466331 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0412  glyoxylate reductase  37.74 
 
 
322 aa  212  9e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0625  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  40.24 
 
 
322 aa  210  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3011  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  41.8 
 
 
315 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3366  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  41.69 
 
 
315 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2490  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.36 
 
 
326 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56603  normal  0.0359578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1325  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.63 
 
 
315 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1370  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.36 
 
 
326 aa  209  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1511  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  39.46 
 
 
330 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.480657  normal  0.0780281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1989  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  38.18 
 
 
332 aa  209  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.14509e-07 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0929  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.81 
 
 
319 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0948  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.81 
 
 
319 aa  207  2e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2643  putative glycerate dehydrogenase  41.98 
 
 
316 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0216  glyoxylate reductase  39.46 
 
 
340 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.17 
 
 
323 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0384  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  37.12 
 
 
338 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3078  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  39.09 
 
 
328 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.295585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1983  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.75 
 
 
313 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275914  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2941  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  39.45 
 
 
324 aa  202  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.320124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4738  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  37.38 
 
 
335 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4324  glyoxylate reductase  39.16 
 
 
341 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0151043  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1858  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase  43.44 
 
 
312 aa  201  1e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3305  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase, NAD-binding  38.05 
 
 
326 aa  201  1e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106249  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05388  2-hydroxyacid dehydrogenase  38.81 
 
 
331 aa  201  1e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2002  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase NAD-binding  43.12 
 
 
312 aa  201  2e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.516178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>