More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4050 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  100 
 
 
289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  82.59 
 
 
293 aa  484  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  83.28 
 
 
293 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  83.39 
 
 
287 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  70.5 
 
 
263 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  69.29 
 
 
271 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  69.29 
 
 
271 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  69.5 
 
 
271 aa  364  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  67.19 
 
 
272 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  67.19 
 
 
272 aa  358  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  67.19 
 
 
272 aa  358  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  66.92 
 
 
267 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  67.31 
 
 
272 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  66.16 
 
 
267 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  55.14 
 
 
272 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  52.67 
 
 
272 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  52.99 
 
 
260 aa  267  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.8 
 
 
259 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  51.15 
 
 
283 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  51.6 
 
 
260 aa  261  1e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  47.3 
 
 
258 aa  259  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  51 
 
 
259 aa  258  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.48 
 
 
291 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.62 
 
 
252 aa  256  4e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  53.68 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.11 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  51.44 
 
 
311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  46.89 
 
 
273 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  54.22 
 
 
253 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.85 
 
 
260 aa  252  6e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  47.83 
 
 
279 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.21 
 
 
251 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  51.44 
 
 
311 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.56 
 
 
254 aa  250  2e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.95 
 
 
264 aa  249  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.13 
 
 
253 aa  249  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.37 
 
 
261 aa  249  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  51.08 
 
 
254 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  53.18 
 
 
274 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.59 
 
 
252 aa  248  6e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.33 
 
 
292 aa  248  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50.22 
 
 
254 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
267 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50 
 
 
256 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 
264 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.16 
 
 
297 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50.2 
 
 
255 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  52.34 
 
 
254 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.78 
 
 
254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.07 
 
 
280 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 
278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  45.15 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  51.03 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  49.58 
 
 
313 aa  242  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.36 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  47.79 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.2 
 
 
259 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.52 
 
 
263 aa  240  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
261 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  50.22 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.87 
 
 
281 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.74 
 
 
307 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.99 
 
 
303 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.38 
 
 
257 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.99 
 
 
303 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.64 
 
 
256 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  49.79 
 
 
303 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  48.26 
 
 
266 aa  238  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.15 
 
 
306 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
278 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.15 
 
 
286 aa  237  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  50 
 
 
258 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  48.77 
 
 
315 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.58 
 
 
258 aa  235  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  53.04 
 
 
261 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.33 
 
 
257 aa  234  9e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.41 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.64 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.15 
 
 
286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  46.99 
 
 
269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.2 
 
 
260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.59 
 
 
259 aa  233  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 
289 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
308 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.74 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.31 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  47.98 
 
 
283 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  50.43 
 
 
261 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.18 
 
 
257 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.4 
 
 
253 aa  232  6e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 
251 aa  232  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.19 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48 
 
 
267 aa  231  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.64 
 
 
283 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.53 
 
 
267 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.63 
 
 
279 aa  231  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  47.01 
 
 
269 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>