More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4010 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
265 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  66.92 
 
 
261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  52.14 
 
 
238 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  52.7 
 
 
257 aa  224  9e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  57.01 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  53.64 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  53.99 
 
 
253 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  51.28 
 
 
310 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  50.41 
 
 
238 aa  205  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  50.23 
 
 
257 aa  204  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  53.78 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  49.58 
 
 
217 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  55.14 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  52.04 
 
 
197 aa  181  9.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  49.55 
 
 
241 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  44.21 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  47.45 
 
 
338 aa  171  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  49.31 
 
 
233 aa  171  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  53.97 
 
 
272 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  46.36 
 
 
336 aa  170  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  46.04 
 
 
240 aa  169  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  50.96 
 
 
254 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  44.32 
 
 
268 aa  168  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  54.32 
 
 
233 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  45.12 
 
 
251 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  48.54 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  53.04 
 
 
231 aa  162  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  45.59 
 
 
254 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  52.6 
 
 
259 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  52.6 
 
 
259 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  48.19 
 
 
223 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  56.3 
 
 
460 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  47.02 
 
 
276 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  58.21 
 
 
251 aa  145  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  50.96 
 
 
262 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  43.33 
 
 
439 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  51.56 
 
 
484 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  51.74 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  54.03 
 
 
210 aa  129  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  58.12 
 
 
120 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  44.2 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  43.1 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  41.09 
 
 
247 aa  94  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  44.83 
 
 
207 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  45.6 
 
 
204 aa  93.2  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  45.3 
 
 
206 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 
191 aa  92  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  46.72 
 
 
199 aa  91.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  43.38 
 
 
195 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  45.67 
 
 
241 aa  89  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  43.06 
 
 
217 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  38.35 
 
 
146 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  35.88 
 
 
196 aa  86.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.13 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.88 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 
211 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.01 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  40.88 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.88 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
209 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
209 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.16 
 
 
226 aa  82  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41.73 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.98 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  41.09 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  39.67 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  40.3 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  42.24 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.84 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40.17 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5361  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.716209 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  38.4 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  38.84 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  37.3 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2791  lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504732  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  38.33 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  38.89 
 
 
217 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  40.87 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  37.12 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2611  lytic transglycosylase catalytic  41.6 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.59616 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  39.17 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  40.87 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  39.5 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  40.83 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>