More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4000 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  100 
 
 
328 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  88.38 
 
 
328 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  86.96 
 
 
342 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.54 
 
 
343 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  84.52 
 
 
327 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.09 
 
 
327 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.79 
 
 
326 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  85 
 
 
327 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.81 
 
 
332 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  81.42 
 
 
329 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  81.71 
 
 
327 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.76 
 
 
327 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.76 
 
 
327 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  83.91 
 
 
322 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  82.65 
 
 
327 aa  519  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  85.29 
 
 
321 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  81.45 
 
 
334 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  79.88 
 
 
334 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  83.07 
 
 
322 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  78.88 
 
 
327 aa  501  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  80.55 
 
 
332 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  77.47 
 
 
326 aa  494  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.27 
 
 
322 aa  491  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.64 
 
 
328 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  79.05 
 
 
326 aa  489  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  80.98 
 
 
305 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  79.69 
 
 
327 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  76.31 
 
 
334 aa  481  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  79.75 
 
 
329 aa  481  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  79.63 
 
 
327 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  74.84 
 
 
327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  69.75 
 
 
325 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.64 
 
 
325 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  70.1 
 
 
323 aa  391  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.44 
 
 
333 aa  374  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  60.51 
 
 
349 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  58.73 
 
 
343 aa  344  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.74 
 
 
350 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  60.06 
 
 
348 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  60.32 
 
 
358 aa  341  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  58.15 
 
 
344 aa  341  9e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.49 
 
 
344 aa  340  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  59.55 
 
 
356 aa  341  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  61.13 
 
 
354 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.94 
 
 
345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.18 
 
 
353 aa  338  8e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.67 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.42 
 
 
356 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  59.87 
 
 
356 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  57.28 
 
 
344 aa  335  5e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.02 
 
 
351 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  58.58 
 
 
355 aa  334  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  57.97 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  53.72 
 
 
320 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  50.64 
 
 
318 aa  285  9e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  48.84 
 
 
323 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  50.5 
 
 
329 aa  269  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  48.01 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  47.23 
 
 
321 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  47.62 
 
 
323 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  45.6 
 
 
366 aa  255  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.39 
 
 
309 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  48.49 
 
 
329 aa  249  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  45.4 
 
 
320 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  45.4 
 
 
320 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.7 
 
 
310 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  46.43 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  47.85 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.45 
 
 
322 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.79 
 
 
322 aa  238  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  45.36 
 
 
322 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  38.83 
 
 
319 aa  236  4e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  44.44 
 
 
320 aa  235  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.42 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  48.06 
 
 
321 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  38.57 
 
 
319 aa  226  4e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  38.37 
 
 
346 aa  198  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  38.82 
 
 
438 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  38.83 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.78 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  40.31 
 
 
440 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  35.92 
 
 
464 aa  162  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  40 
 
 
438 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
442 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  37.87 
 
 
491 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  38.23 
 
 
450 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  37.37 
 
 
468 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  34.63 
 
 
472 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  34.67 
 
 
455 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  40 
 
 
440 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  35 
 
 
455 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  35.91 
 
 
477 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.11 
 
 
473 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  34.44 
 
 
572 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  34.67 
 
 
455 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  36.91 
 
 
342 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  36.63 
 
 
634 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  38.53 
 
 
451 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  38.53 
 
 
451 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  38.78 
 
 
438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>