148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3991 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  86.51 
 
 		 415 aa  660    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 414 aa  814    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  76.3 
 
 		 421 aa  598  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  74.88 
 
 		 418 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  68.59 
 
 		 411 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  64.99 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  67.17 
 
 		 401 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2315  conjugation TrbI-like protein  66.24 
 
 		 396 aa  489  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0500  conjugation TrbI-like protein  64.23 
 
 		 399 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.167407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7750  putative conjugal transfer protein trbI  64.12 
 
 		 399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911232  normal  0.149579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1185  conjugation TrbI family protein  64.77 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3550  conjugation TrbI family protein  64.77 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  61.06 
 
 		 402 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  58.45 
 
 		 400 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  64.27 
 
 		 375 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  64.14 
 
 		 383 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  57.14 
 
 		 402 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  61.3 
 
 		 388 aa  428  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  54.81 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  58.59 
 
 		 411 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3860  conjugation TrbI-like protein  60.21 
 
 		 388 aa  415  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.757301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0147  conjugation TrbI family protein  58.87 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1475  conjugation TrbI family protein  61.66 
 
 		 373 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  59.44 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3700  conjugation TrbI family protein  55.24 
 
 		 405 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  59.48 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  49.87 
 
 		 392 aa  355  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  54.19 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  52.31 
 
 		 430 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  52.9 
 
 		 400 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  53.39 
 
 		 386 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  47.28 
 
 		 397 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  49.75 
 
 		 393 aa  305  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  43.51 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  42.55 
 
 		 420 aa  278  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  43.13 
 
 		 423 aa  276  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  42.59 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  43.03 
 
 		 426 aa  272  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  43.56 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  41.65 
 
 		 423 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  43.24 
 
 		 423 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  42.17 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  44.15 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  41.25 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  41.41 
 
 		 427 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  44.11 
 
 		 424 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  40.96 
 
 		 423 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  41.59 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  37.95 
 
 		 431 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  39.45 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  39.34 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  40.05 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2035  conjugation TrbI family protein  40.72 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  37.22 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0735  conjugation TrbI family protein  39.68 
 
 		 379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.997406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2355  conjugation TrbI family protein  39.14 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  33.89 
 
 		 410 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5214  conjugation TrbI family protein  51.56 
 
 		 408 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  39.08 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5367  conjugation TrbI family protein  47.75 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196515  normal  0.456411 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  38.21 
 
 		 426 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  38.62 
 
 		 437 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  37.93 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  41.18 
 
 		 431 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  39.29 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  43.01 
 
 		 473 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1711  conjugation TrbI family protein  42.13 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000031555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  43.01 
 
 		 473 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0054  conjugal transfer protein TrbI  40.95 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  43.01 
 
 		 472 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  37.9 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  40.72 
 
 		 466 aa  161  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  42.78 
 
 		 190 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  37.93 
 
 		 439 aa  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  35.63 
 
 		 490 aa  147  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  36.02 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  35.41 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2826  conjugation TrbI family protein  34.22 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  36.46 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 403 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  38.38 
 
 		 486 aa  112  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  39.78 
 
 		 469 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  37.37 
 
 		 483 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  34.8 
 
 		 410 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  34.78 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  37.7 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  34.57 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  34.53 
 
 		 363 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  38.59 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  34.55 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  30.59 
 
 		 447 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  33.95 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4239  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.518635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  30.59 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3695  conjugation TrbI family protein  30.14 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.856917 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  34.24 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4756  conjugation TrbI family protein  30 
 
 		 444 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.745717 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  33.51 
 
 		 459 aa  96.7  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  35.42 
 
 		 459 aa  96.3  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>