More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3899 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3899  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  263  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.485004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3458  rhodanese-like protein  68.18 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.204377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2917  rhodanese-like protein  68.99 
 
 		 137 aa  186  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6257  hypothetical protein  67.69 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4134  Rhodanese domain protein  65.15 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.64767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2125  rhodanese-like protein  68.18 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.949088  normal  0.0126023 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1914  rhodanese-like protein  66.92 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0674986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2504  Rhodanese domain-containing protein  63.11 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0272  hypothetical protein  55.73 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0460  rhodanese domain-containing protein  54.76 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.821321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2310  rhodanese-like protein  54.03 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4591  rhodanese domain-containing protein  59.5 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1561  Rhodanese domain protein  51.24 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3836  rhodanese-like protein  52.38 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1857  rhodanese domain-containing protein  51.24 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.483436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2537  rhodanese-like protein  53.23 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4183  rhodanese-like protein  50.79 
 
 		 140 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2110  rhodanese-like protein  61.05 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.972039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6071  putative rhodanese-related sulfurtransferase  50.4 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0114  Rhodanese domain protein  50 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4150  Rhodanese domain protein  51.22 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0127  rhodanese domain-containing protein  47.2 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.344636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4620  rhodanese-like protein  43.55 
 
 		 130 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178094  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4291  rhodanese-like protein  42.74 
 
 		 130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.144766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2299  rhodanese-like protein  45.76 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.688081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2891  rhodanese domain-containing protein  43.55 
 
 		 130 aa  106  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2199  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.331265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2076  rhodanese-like protein  44 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0548  hypothetical protein  43.2 
 
 		 131 aa  103  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1239  rhodanese domain-containing protein  43.2 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4950  Rhodanese domain protein  44.17 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.369685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4185  rhodanese-like protein  39.52 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.522252 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1202  rhodanese-like protein  39.84 
 
 		 125 aa  95.9  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  39.67 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1936  rhodanese-like protein  41.8 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.060767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46930  Rhodanese-domain protein  41.38 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1388  Rhodanese domain protein  40.17 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267933  normal  0.0200875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4874  Rhodanese domain protein  38.4 
 
 		 134 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3082  Rhodanese domain protein  39.83 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689626  normal  0.0783096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0472  Rhodanese domain protein  38.21 
 
 		 163 aa  80.1  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3553  rhodanese domain-containing protein  37.19 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1109  rhodanese-like  58.46 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2834  rhodanese domain-containing protein  38.79 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  40.17 
 
 		 388 aa  75.5  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3667  beta-lactamase-like  37.96 
 
 		 346 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  40.4 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  40.4 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0691  putative Zn-dependent hydrolase including glyoxylases /rhodanese-related sulfurtransferase  41.3 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4344  Rhodanese domain protein  35.77 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.987797  normal  0.626066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2895  beta-lactamase-like protein  37.04 
 
 		 346 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00973984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4982  rhodanese domain-containing protein  38.66 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.497826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2034  rhodanese domain-containing protein  34.75 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  34.43 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1733  hypothetical protein  33.06 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1579  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00521027  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  36.52 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1483  rhodanese-like protein  36.97 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197506  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1844  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.29 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  33.9 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  33.61 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1733  hypothetical protein  32.23 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1689  Rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168466  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0333  rhodanese domain-containing protein  37.29 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.891512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4167  rhodanese-like protein  33.06 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4389  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4233  rhodanese domain-containing protein  33.06 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3323  Rhodanese domain protein  35.34 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4148  cysteine dioxygenase type I  33.33 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4683  rhodanese domain-containing protein  32.46 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0692547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.65 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  39.45 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  37.84 
 
 		 476 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2646  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 344 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4940  Rhodanese domain protein  36.94 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  35.09 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  38.33 
 
 		 480 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  34.23 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1680  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  35.54 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11084  hypothetical protein  36.27 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.7245e-55  normal  0.140954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  34.48 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2260  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  36.28 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4510  rhodanese domain-containing protein  38.94 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4973  Rhodanese domain protein  38.94 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4038  Rhodanese domain protein  34.13 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.686364  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0195  rhodanese domain-containing protein  40.86 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2887  rhodanese-like protein  35.19 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.52776  hitchhiker  0.0000448823 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2632  rhodanese-like protein  35.94 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.437689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  30.97 
 
 		 361 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  35.54 
 
 		 346 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0494  rhodanese-like protein  36.45 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2080  rhodanese-like protein  38.39 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.59 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  36.75 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3514  hypothetical protein  38.39 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.308602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  32.73 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2435  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00096  Rhodanese-related sulfurtransferase  33.06 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>