14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3567 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3567  hypothetical protein  100 
 
 		 1798 aa  3519    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  35.21 
 
 		 621 aa  209  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1687  putative calcium binding protein  32.78 
 
 		 463 aa  185  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0963  hypothetical protein  23.68 
 
 		 448 aa  92.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  28.5 
 
 		 870 aa  90.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  25.07 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0190  hypothetical protein  26.5 
 
 		 427 aa  81.3  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  23.2 
 
 		 788 aa  67.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3589  hypothetical protein  24.2 
 
 		 943 aa  63.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00513024  normal  0.358288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.62 
 
 		 4836 aa  62.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  27.96 
 
 		 2731 aa  60.1  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  29.13 
 
 		 7434 aa  46.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  22.87 
 
 		 1679 aa  46.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1086 aa  46.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>