More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3551 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  70.11 
 
 
441 aa  653    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
438 aa  890    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  74.07 
 
 
438 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  73.61 
 
 
434 aa  664    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  72.77 
 
 
447 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  74.07 
 
 
434 aa  663    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4606  nucleotide sugar dehydrogenase  72.75 
 
 
456 aa  657    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.094228  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0543  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  72.06 
 
 
433 aa  640    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.873021 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  74.07 
 
 
438 aa  668    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  73.44 
 
 
434 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.64 
 
 
437 aa  663    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  72.45 
 
 
433 aa  658    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  75.75 
 
 
463 aa  662    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  69.66 
 
 
442 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  74.19 
 
 
439 aa  682    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  76.91 
 
 
440 aa  697    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  73.67 
 
 
434 aa  681    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  72.52 
 
 
435 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4156  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.5 
 
 
438 aa  656    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  73.61 
 
 
434 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2755  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.21 
 
 
436 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  74.07 
 
 
438 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  74.54 
 
 
452 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  70.11 
 
 
435 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7353  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.44 
 
 
439 aa  664    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.870632  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  73.21 
 
 
436 aa  654    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  73.5 
 
 
436 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.05 
 
 
434 aa  632  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 
433 aa  634  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2380  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  71.79 
 
 
436 aa  629  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.289477  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  71.13 
 
 
436 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  69.35 
 
 
438 aa  609  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1921  UDP-glucose 6-dehydrogenase  67.74 
 
 
434 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455282  normal  0.479029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  62.82 
 
 
451 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  61.52 
 
 
438 aa  565  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.14 
 
 
434 aa  541  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.19 
 
 
438 aa  544  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  60.41 
 
 
449 aa  543  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  61.06 
 
 
437 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.45 
 
 
434 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.45 
 
 
434 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  60.83 
 
 
434 aa  528  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  59.91 
 
 
464 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  59.55 
 
 
441 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 
478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0476  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.68 
 
 
474 aa  512  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.10273  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0545  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.45 
 
 
474 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1714  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.78 
 
 
436 aa  494  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1348  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.47 
 
 
460 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.233315  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0210  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.06 
 
 
453 aa  475  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22770  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.94 
 
 
460 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.57 
 
 
443 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1502  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.73 
 
 
438 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.842125  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5066  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.8 
 
 
440 aa  455  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3767  nucleotide sugar dehydrogenase  53.1 
 
 
473 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0312169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0866  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.85 
 
 
467 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.359864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3001  nucleotide sugar dehydrogenase  50 
 
 
438 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4305  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.41 
 
 
436 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.434047  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  51.03 
 
 
446 aa  441  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4441  nucleotide sugar dehydrogenase  52.63 
 
 
435 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4460  nucleotide sugar dehydrogenase  52.86 
 
 
436 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3526  nucleotide sugar dehydrogenase  49.54 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3925  nucleotide sugar dehydrogenase  49.08 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107099  normal  0.0149623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  50.69 
 
 
442 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3615  nucleotide sugar dehydrogenase  49.08 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285308  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1859  nucleotide sugar dehydrogenase  48.75 
 
 
466 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  49.3 
 
 
427 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2363  nucleotide sugar dehydrogenase  51.03 
 
 
448 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000065452  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1956  nucleotide sugar dehydrogenase  49.34 
 
 
482 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373537  normal  0.743154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2245  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.89 
 
 
482 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1022  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.44 
 
 
452 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000993362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1116  nucleotide sugar dehydrogenase  49.08 
 
 
437 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1185  nucleotide sugar dehydrogenase  49.08 
 
 
437 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2339  nucleotide sugar dehydrogenase  49.89 
 
 
443 aa  430  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3094  nucleotide sugar dehydrogenase  47.75 
 
 
440 aa  431  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0726  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  48.34 
 
 
457 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132255  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2308  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.44 
 
 
450 aa  429  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000179328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2565  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.23 
 
 
457 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.208058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1466  UDP-glucose 6-dehydrogenase  50.11 
 
 
445 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.434969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1430  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  49.55 
 
 
450 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000289789  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2178  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.75 
 
 
447 aa  425  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.7 
 
 
467 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1693  nucleotide sugar dehydrogenase  47.96 
 
 
445 aa  425  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.110562  hitchhiker  0.00856066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0901  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.2 
 
 
440 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.665804  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3394  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.2 
 
 
440 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.852833  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.98 
 
 
447 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2622  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.34 
 
 
473 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1142  nucleotide sugar dehydrogenase  47.86 
 
 
451 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2487  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.89 
 
 
442 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  49.78 
 
 
449 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0961  UDP-glucose dehydrogenase  48.64 
 
 
440 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.837953  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0917  UDP-glucose 6-dehydrogenase 2  49.34 
 
 
473 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.853858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1710  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.98 
 
 
448 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1057  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.28 
 
 
437 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2484  UDP-glucose 6-dehydrogenase  49.34 
 
 
473 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0400  nucleotide sugar dehydrogenase  50.91 
 
 
446 aa  422  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0927  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.9 
 
 
466 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.749259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38360  putative nucleotide sugar dehydrogenase  48.08 
 
 
453 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0121251 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0712  nucleotide sugar dehydrogenase  49.2 
 
 
438 aa  424  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  51.14 
 
 
446 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>