216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3419 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3942  permease  96.05 
 
 		 354 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  100 
 
 		 354 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  77.91 
 
 		 350 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  78.25 
 
 		 353 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  72.16 
 
 		 352 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  76.83 
 
 		 351 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  69.47 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  66.77 
 
 		 345 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  69.11 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  76.42 
 
 		 349 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  65.44 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  65.15 
 
 		 367 aa  415  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  65.03 
 
 		 330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  61 
 
 		 351 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  60.91 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  64.38 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  63.38 
 
 		 363 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  59.6 
 
 		 353 aa  401  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  59.76 
 
 		 352 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  64.44 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  60.06 
 
 		 351 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  61.1 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  57.39 
 
 		 356 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  61.31 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  60.7 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  64.63 
 
 		 381 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1027  transporter  65.02 
 
 		 366 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  61.9 
 
 		 377 aa  383  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  58.18 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  65.92 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  63.42 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  54.31 
 
 		 315 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  53.99 
 
 		 315 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  56.95 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  52.66 
 
 		 315 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  50.32 
 
 		 323 aa  322  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  54.92 
 
 		 315 aa  322  8e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  53.62 
 
 		 349 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  53.82 
 
 		 317 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  49.84 
 
 		 319 aa  312  6.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  53.65 
 
 		 315 aa  308  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  47.35 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  43.95 
 
 		 323 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  54.49 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  44.76 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  51.99 
 
 		 322 aa  292  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  48.82 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  52.32 
 
 		 349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  44.37 
 
 		 336 aa  281  1e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  48.52 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  46.08 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  46.96 
 
 		 331 aa  269  7e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  40.73 
 
 		 335 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  44.78 
 
 		 334 aa  263  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  48.68 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  39.02 
 
 		 330 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  39.51 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  40.97 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  40.97 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  44.33 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  42.46 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  42.46 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  42.95 
 
 		 370 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  42.15 
 
 		 331 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  42.2 
 
 		 331 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  39.51 
 
 		 337 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  38.65 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  41.85 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  43.33 
 
 		 353 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  41.9 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  45.76 
 
 		 318 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  41.23 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  43.45 
 
 		 354 aa  249  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  45.76 
 
 		 318 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  43.67 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  40.91 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  43.51 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  41.39 
 
 		 371 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  40.45 
 
 		 338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  41.26 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  42.81 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  43.34 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  38.76 
 
 		 328 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  41.73 
 
 		 284 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  38.31 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  33.11 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  40.78 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  37.76 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  32.13 
 
 		 311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  34.31 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  36.13 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  30.51 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  30.16 
 
 		 316 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  28.87 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  29.17 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  29.17 
 
 		 345 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0357  permease  34.47 
 
 		 294 aa  149  7e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0083  putative permease  30.23 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0315  permease  30.31 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  29.87 
 
 		 307 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>