More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3384 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  100 
 
 
359 aa  721    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  47.56 
 
 
407 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  49.14 
 
 
385 aa  278  8e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  44.1 
 
 
382 aa  266  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  43.79 
 
 
385 aa  265  8e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  41.26 
 
 
383 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  43.97 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  45.15 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  41.05 
 
 
383 aa  252  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  41.29 
 
 
389 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  43.41 
 
 
390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  44.16 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  42.62 
 
 
344 aa  243  5e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  42.24 
 
 
355 aa  238  9e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  44.17 
 
 
359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  43.73 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  41.12 
 
 
360 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  42.26 
 
 
367 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  40.91 
 
 
357 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  40.89 
 
 
361 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  41.31 
 
 
347 aa  223  4.9999999999999996e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  39.93 
 
 
405 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  39.34 
 
 
387 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  42.81 
 
 
413 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  42.23 
 
 
379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  39.13 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1561  HflK protein  38.89 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.920628  hitchhiker  0.00000000145898 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1886  hflK protein  38.89 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  41.32 
 
 
393 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  41.5 
 
 
362 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  41.5 
 
 
382 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  42.12 
 
 
383 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  38.36 
 
 
379 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.55 
 
 
403 aa  209  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  37.46 
 
 
389 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  38.05 
 
 
386 aa  205  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  40.41 
 
 
394 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  39.13 
 
 
394 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  38.54 
 
 
394 aa  202  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  39.71 
 
 
376 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  40.91 
 
 
360 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  37.86 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  40.88 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  37.86 
 
 
399 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  39.49 
 
 
384 aa  199  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  39.49 
 
 
382 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  39.46 
 
 
399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  38.26 
 
 
387 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  40.41 
 
 
389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  36.9 
 
 
386 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  39.1 
 
 
406 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.81 
 
 
362 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  38.8 
 
 
393 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  38.8 
 
 
393 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.97 
 
 
451 aa  193  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  38.31 
 
 
382 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  38.31 
 
 
382 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.97 
 
 
451 aa  193  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  37.29 
 
 
471 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  36.61 
 
 
452 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  37.23 
 
 
436 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  35.93 
 
 
474 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  36.36 
 
 
308 aa  190  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  36.36 
 
 
308 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  38.16 
 
 
464 aa  189  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  33.13 
 
 
471 aa  189  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  38.01 
 
 
405 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  36.52 
 
 
393 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  37.46 
 
 
393 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  38.43 
 
 
393 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.39 
 
 
433 aa  188  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  38.01 
 
 
393 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  36.61 
 
 
464 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.13 
 
 
351 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  36.23 
 
 
391 aa  186  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  35.93 
 
 
389 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  31.54 
 
 
503 aa  186  5e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1321  HflK protein  35.76 
 
 
331 aa  186  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  37.59 
 
 
399 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  37.55 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  33.45 
 
 
447 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  37.72 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  31.99 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  38.43 
 
 
400 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2775  HflK protein  36.24 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  37.72 
 
 
395 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  35.37 
 
 
465 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  36.24 
 
 
394 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  32.42 
 
 
435 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3678  HflK protein  34.3 
 
 
350 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  35.71 
 
 
441 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2760  hflK protein  34.05 
 
 
395 aa  178  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.467094  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3613  HflK protein  34.56 
 
 
350 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  35.71 
 
 
453 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  34.51 
 
 
457 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  34.98 
 
 
379 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  32.5 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  36.96 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3522  HflK protein  36.59 
 
 
378 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  36.68 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>