More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3372 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  590  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  57.81 
 
 
284 aa  255  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  58.9 
 
 
242 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  58.47 
 
 
242 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  56.78 
 
 
255 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  48.55 
 
 
250 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  45.85 
 
 
249 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  43.17 
 
 
234 aa  153  3e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  43.53 
 
 
246 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  44.44 
 
 
236 aa  146  4e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  44.44 
 
 
236 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
251 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  39.37 
 
 
262 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
268 aa  142  9e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 
248 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
270 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  38.06 
 
 
253 aa  139  8e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  38.84 
 
 
249 aa  139  8e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  37.84 
 
 
273 aa  139  8e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  9.57079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
268 aa  138  9e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  38.13 
 
 
272 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  39.26 
 
 
237 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  38.84 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  43.11 
 
 
232 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 
237 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
274 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  40.26 
 
 
244 aa  135  7e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 
247 aa  135  1e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  37.66 
 
 
249 aa  133  4e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  37.66 
 
 
249 aa  133  4e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  37.66 
 
 
249 aa  133  4e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
247 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  37.13 
 
 
248 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  36.44 
 
 
247 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  37.23 
 
 
253 aa  132  1e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 
273 aa  131  1e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
253 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  38.16 
 
 
246 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  38.03 
 
 
249 aa  129  7e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.53 
 
 
255 aa  128  1e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
245 aa  128  1e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  38.72 
 
 
251 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 
249 aa  125  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
254 aa  125  8e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 
249 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 
253 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 
253 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  39.68 
 
 
252 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  41.3 
 
 
237 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  38.05 
 
 
251 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  35.39 
 
 
251 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
259 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  8.56086e-05  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  40.83 
 
 
264 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  40.72 
 
 
233 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
240 aa  122  1e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  41.96 
 
 
233 aa  121  1e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  37.07 
 
 
238 aa  120  2e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 
247 aa  120  2e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 
266 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
272 aa  119  4e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  37.23 
 
 
248 aa  117  2e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
288 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  38.25 
 
 
234 aa  116  4e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
246 aa  116  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
246 aa  116  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
234 aa  112  8e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  41.07 
 
 
244 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  37.55 
 
 
242 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  34.44 
 
 
254 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  34.71 
 
 
254 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  43.86 
 
 
260 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  38.16 
 
 
243 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 
249 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  44.54 
 
 
233 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  37.83 
 
 
234 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 
235 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
231 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 
240 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  38.5 
 
 
226 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  2.53482e-06 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  39.05 
 
 
242 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  35.53 
 
 
236 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 
238 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 
255 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  38.77 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  37.19 
 
 
264 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  34.65 
 
 
238 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  37.44 
 
 
234 aa  96.3  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  36.07 
 
 
234 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  34.73 
 
 
252 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.73 
 
 
235 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  30.38 
 
 
230 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  35.32 
 
 
233 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.38 
 
 
240 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 
234 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  33.96 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  38.97 
 
 
229 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
240 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>