More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3371 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3371  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  100 
 
 
301 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3655  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  75.08 
 
 
301 aa  465  1e-130  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3393  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  75.42 
 
 
301 aa  465  1e-130  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1947  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  73.42 
 
 
301 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357262  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5701  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  70.43 
 
 
301 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1689  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  62.16 
 
 
308 aa  387  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448176  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1875  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  61.15 
 
 
307 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207996  normal  0.131652 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5081  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  61.82 
 
 
301 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5345  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  54.7 
 
 
301 aa  347  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  56.9 
 
 
313 aa  339  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603765  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6531  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  55.22 
 
 
305 aa  325  4e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3688  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.72 
 
 
304 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4103  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  55.22 
 
 
305 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2587  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  55.56 
 
 
303 aa  322  6e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233222  hitchhiker  0.00609542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1993  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  54.21 
 
 
303 aa  320  1e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0280124  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4736  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.04 
 
 
304 aa  321  1e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.473225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1793  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  54.21 
 
 
303 aa  320  1e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1729  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  54.88 
 
 
303 aa  315  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  9.52381e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4951  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.72 
 
 
304 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551688  normal  0.0100534 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3049  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.72 
 
 
304 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.62883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.72 
 
 
304 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0332  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.38 
 
 
304 aa  314  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3408  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.38 
 
 
304 aa  313  2e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.996701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1215  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.2 
 
 
303 aa  313  2e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  0.0261102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5204  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.38 
 
 
304 aa  313  2e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.484805  normal  0.145003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4676  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.38 
 
 
304 aa  313  2e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0185  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.04 
 
 
336 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2814  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.19 
 
 
303 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05220  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  54.88 
 
 
303 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3599  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.53 
 
 
303 aa  310  3e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815897  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0827  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.2 
 
 
303 aa  310  3e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0328842  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1802  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.17 
 
 
305 aa  308  1e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0287622  hitchhiker  0.00208874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3098  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.19 
 
 
303 aa  307  1e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.01 
 
 
311 aa  307  1e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1596  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.18 
 
 
303 aa  307  2e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4864  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.84 
 
 
305 aa  307  2e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556224  normal  0.0460344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2317  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.85 
 
 
303 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612252  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4586  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.35 
 
 
312 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4452  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.35 
 
 
312 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0251  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  53.54 
 
 
303 aa  306  4e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.56 
 
 
307 aa  303  2e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4227  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.53 
 
 
303 aa  303  2e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.881982  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4549  dihydrodipicolinate synthetase family protein  52.53 
 
 
303 aa  303  3e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.301477  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1117  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.19 
 
 
303 aa  301  6e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5150  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  52.82 
 
 
304 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3419  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  51.01 
 
 
328 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269003  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2499  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  47.99 
 
 
304 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2392  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  49.65 
 
 
304 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.088042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0351  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.64 
 
 
304 aa  244  2e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0037  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  46.64 
 
 
304 aa  243  4e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5157  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.4 
 
 
321 aa  212  5e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414541  hitchhiker  0.0087046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1718  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  43.15 
 
 
301 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2020  dihydrodipicolinate synthetase  41.92 
 
 
301 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.874189  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4201  dihydrodipicolinate synthetase  42.01 
 
 
308 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4039  dihydrodipicolinate synthetase  39.53 
 
 
321 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7513  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  41.88 
 
 
326 aa  196  5e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1084  dihydrodipicolinate synthetase  43.79 
 
 
301 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00262766  hitchhiker  0.00208818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0755  dihydrodipicolinate synthetase  40.96 
 
 
311 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  39.8 
 
 
330 aa  188  9e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1030  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.14 
 
 
313 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.113729  normal  0.255193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3337  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  37.72 
 
 
301 aa  172  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3137  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  40.34 
 
 
300 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.321867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0788  dihydrodipicolinate synthetase  39.52 
 
 
306 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.049848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0675  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  74.7 
 
 
87 aa  127  2e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  0.308708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1498  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  37.88 
 
 
291 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 
294 aa  117  2e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0848  dihydrodipicolinate synthase  35.84 
 
 
298 aa  110  2e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1237  dihydrodipicolinate synthetase  44.53 
 
 
199 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
293 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.72 
 
 
293 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 
293 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  33.62 
 
 
300 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  33.61 
 
 
300 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0673  dihydrodipicolinate synthase  33.18 
 
 
294 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517741  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1890  dihydrodipicolinate synthase  35.54 
 
 
299 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  32.87 
 
 
296 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2640  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 
296 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2602  dihydrodipicolinate synthase  31.95 
 
 
296 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64796e-05 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2961  dihydrodipicolinate synthase  32.33 
 
 
296 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1080  dihydrodipicolinate synthase  32.4 
 
 
305 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0649604  hitchhiker  0.00385638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.49 
 
 
293 aa  98.2  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  31.68 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  34.08 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  31.69 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  31.68 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.59 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 
298 aa  95.9  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  31.82 
 
 
294 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  27.3 
 
 
298 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  31.62 
 
 
292 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  6.0181e-05  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 
298 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1389  dihydrodipicolinate synthase  32.06 
 
 
308 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  28.08 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0033  dihydrodipicolinate synthetase  30.74 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>