More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3362 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  338  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  79.65 
 
 		 172 aa  276  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  80.23 
 
 		 172 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  76.74 
 
 		 172 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  78.29 
 
 		 175 aa  264  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  77.14 
 
 		 175 aa  264  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  76.16 
 
 		 172 aa  260  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  74.42 
 
 		 172 aa  257  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  74.42 
 
 		 172 aa  256  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  79.65 
 
 		 172 aa  255  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  79.65 
 
 		 172 aa  255  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  73.84 
 
 		 172 aa  255  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  73.84 
 
 		 172 aa  253  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  72.09 
 
 		 172 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  71.51 
 
 		 172 aa  249  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  68.02 
 
 		 172 aa  245  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  68.6 
 
 		 172 aa  244  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  243  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 195 aa  236  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  74.27 
 
 		 171 aa  235  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  65.7 
 
 		 172 aa  234  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  232  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 172 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  62.79 
 
 		 194 aa  228  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 		 172 aa  221  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  218  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  63.74 
 
 		 171 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  63.16 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  59.65 
 
 		 171 aa  204  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  54.65 
 
 		 172 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  61.31 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  181  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  176  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  55.56 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  53.8 
 
 		 171 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  51.74 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  46.54 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  43.02 
 
 		 172 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  43.31 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  44.2 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  38.73 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  43.42 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  43.42 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  41.4 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  42.68 
 
 		 176 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  44.44 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  39.49 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  40.79 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  40.59 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  37.13 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  42.11 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  42.97 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.67 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  32.75 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  37.09 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  34.5 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0040  50S ribosomal protein L10  42.97 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0245031  hitchhiker  0.0000000000023806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  36.31 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  35.47 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  34.52 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  40.24 
 
 		 173 aa  101  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08440  ribosomal protein L10  37.8 
 
 		 173 aa  101  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.166227  normal  0.704722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  37.32 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  33.73 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  35.03 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0044  50S ribosomal protein L10  41.41 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>