78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3299 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  45.61 
 
 		 1049 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  47.57 
 
 		 1048 aa  778    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  45.38 
 
 		 1045 aa  656    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  46.83 
 
 		 1049 aa  753    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  45.58 
 
 		 1049 aa  751    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  46.69 
 
 		 1042 aa  728    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  46.64 
 
 		 1048 aa  728    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  45.15 
 
 		 1047 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  45 
 
 		 1047 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  45.86 
 
 		 1053 aa  738    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  100 
 
 		 1015 aa  1926    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  41.67 
 
 		 1001 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  44.93 
 
 		 1054 aa  618  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  45.31 
 
 		 1037 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  43.06 
 
 		 1042 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  40.76 
 
 		 1052 aa  598  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  45.24 
 
 		 1040 aa  592  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  41.6 
 
 		 1043 aa  592  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1052 aa  580  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  42.16 
 
 		 1052 aa  582  1e-164  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  38.82 
 
 		 1076 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  40.66 
 
 		 1018 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  38.4 
 
 		 1059 aa  526  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  38.33 
 
 		 1064 aa  516  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  34.89 
 
 		 1047 aa  506  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  38.1 
 
 		 1064 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  36.51 
 
 		 1062 aa  492  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  39.01 
 
 		 999 aa  489  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  39.41 
 
 		 1016 aa  477  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  35.17 
 
 		 977 aa  410  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  36.79 
 
 		 1014 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  36.3 
 
 		 1000 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  36.03 
 
 		 997 aa  392  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  35.83 
 
 		 997 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  36.03 
 
 		 991 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  34.27 
 
 		 986 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  36.4 
 
 		 991 aa  343  7e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  32.69 
 
 		 988 aa  325  2e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  33.72 
 
 		 993 aa  319  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  36.76 
 
 		 959 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  33.02 
 
 		 980 aa  291  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  19.29 
 
 		 914 aa  145  3e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  18.61 
 
 		 911 aa  132  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.47 
 
 		 890 aa  126  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  30.23 
 
 		 836 aa  97.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  26.6 
 
 		 779 aa  83.6  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  28.06 
 
 		 976 aa  75.1  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.26 
 
 		 962 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  24.18 
 
 		 781 aa  70.9  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.54 
 
 		 957 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  27.7 
 
 		 984 aa  68.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1039 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  28.48 
 
 		 908 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  34.63 
 
 		 1049 aa  66.2  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  28.49 
 
 		 997 aa  63.9  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.17 
 
 		 958 aa  64.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.76 
 
 		 788 aa  64.3  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.51 
 
 		 788 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2171  hypothetical protein  34.68 
 
 		 142 aa  63.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  26.09 
 
 		 947 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.37 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  31.63 
 
 		 864 aa  60.1  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  22.36 
 
 		 951 aa  58.9  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  27.67 
 
 		 855 aa  56.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1000 aa  55.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  21.05 
 
 		 786 aa  54.7  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  22.96 
 
 		 968 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  36.61 
 
 		 1050 aa  50.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  20.09 
 
 		 909 aa  50.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00780  hypothetical protein  25.91 
 
 		 990 aa  50.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  26.36 
 
 		 1059 aa  51.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1100 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  31.34 
 
 		 846 aa  50.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.36 
 
 		 781 aa  49.7  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  25.04 
 
 		 951 aa  48.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.31 
 
 		 989 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  24.85 
 
 		 994 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2361  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.74 
 
 		 1113 aa  45.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>