More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3140 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 604 aa  801    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  70.51 
 
 		 595 aa  900    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  80.55 
 
 		 590 aa  1037    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 		 614 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  70.03 
 
 		 595 aa  910    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  65.18 
 
 		 607 aa  833    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 593 aa  737    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 623 aa  1280    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  70.19 
 
 		 596 aa  908    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  70.03 
 
 		 595 aa  910    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  82.33 
 
 		 590 aa  1052    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 604 aa  785    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 604 aa  796    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 591 aa  834    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  67.73 
 
 		 601 aa  884    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  62.96 
 
 		 590 aa  810    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  80.71 
 
 		 591 aa  1041    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 625 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 591 aa  826    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 599 aa  719    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 606 aa  715    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  80.23 
 
 		 590 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  63 
 
 		 593 aa  793    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  63.29 
 
 		 591 aa  813    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  69.87 
 
 		 595 aa  905    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  80.06 
 
 		 590 aa  1034    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  68.6 
 
 		 597 aa  868    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  80.06 
 
 		 590 aa  1033    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  81.04 
 
 		 590 aa  1046    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  61.53 
 
 		 609 aa  793    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 594 aa  820    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 619 aa  734    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 595 aa  712    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  72.99 
 
 		 594 aa  942    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  66.19 
 
 		 596 aa  876    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 591 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  60.35 
 
 		 605 aa  773    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  70.19 
 
 		 596 aa  909    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  60.71 
 
 		 623 aa  775    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 		 604 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  63.77 
 
 		 591 aa  816    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 590 aa  633  1e-180  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  49.11 
 
 		 590 aa  634  1e-180  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 		 605 aa  609  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 601 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 608 aa  605  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 600 aa  601  1e-170  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 608 aa  598  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 		 604 aa  600  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 605 aa  598  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 606 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 581 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 588 aa  560  1e-158  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 603 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 588 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 589 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 600 aa  493  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 589 aa  486  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 597 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 627 aa  476  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 594 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 594 aa  478  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 592 aa  477  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 619 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 598 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 606 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 599 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 595 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 592 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 598 aa  467  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 593 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 599 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 598 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 586 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 590 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 594 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 602 aa  465  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 599 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 599 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0653  aspartyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 582 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0244847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 593 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 600 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 610 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 601 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 613 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 617 aa  458  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1719  aspartyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 592 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 597 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 614 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 591 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 591 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 591 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 593 aa  452  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 591 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 591 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1333  aspartyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 579 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0605177  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 607 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 590 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000146204  normal  0.319945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>