25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3036 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1207    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1207    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1207    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4230  hypothetical protein  53.5 
 
 
600 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  51.58 
 
 
595 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  44.69 
 
 
613 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  41.5 
 
 
602 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4143  hypothetical protein  41.61 
 
 
594 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  31.18 
 
 
599 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4578  hypothetical protein  25.4 
 
 
574 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5288  hypothetical protein  25.4 
 
 
574 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0167  hypothetical protein  25.79 
 
 
629 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  23.1 
 
 
552 aa  67.4  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2254  hypothetical protein  23.59 
 
 
606 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706828  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  27.47 
 
 
579 aa  62  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  24.17 
 
 
330 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  22.74 
 
 
548 aa  56.6  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2617  hypothetical protein  32.76 
 
 
623 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129951  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4885  hypothetical protein  35.14 
 
 
617 aa  53.9  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.925702  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  24.68 
 
 
538 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  20.81 
 
 
545 aa  50.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  20.81 
 
 
545 aa  50.8  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  26.06 
 
 
559 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6754  hypothetical protein  31.54 
 
 
633 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5715  hypothetical protein  36.62 
 
 
324 aa  44.3  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386341  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>