More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2985 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  43.84 
 
 		 1107 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2985  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1131 aa  2261    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.105436  normal  0.309308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3105  UvrD/REP helicase  90.45 
 
 		 1047 aa  1842    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  47.76 
 
 		 1115 aa  910    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  47.56 
 
 		 1110 aa  904    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  53.91 
 
 		 1117 aa  1107    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4021  UvrD/REP helicase  30.77 
 
 		 1111 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3984  UvrD/REP helicase  31.42 
 
 		 1111 aa  228  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  27.29 
 
 		 1161 aa  221  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  28.55 
 
 		 1184 aa  215  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 1149 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3878  UvrD/REP helicase  34.49 
 
 		 1111 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  28.62 
 
 		 1157 aa  187  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  31.75 
 
 		 1110 aa  184  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  27.23 
 
 		 1156 aa  183  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  25.85 
 
 		 1074 aa  181  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.93 
 
 		 1226 aa  177  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1295  double-strand break repair helicase AddA  28.51 
 
 		 1185 aa  176  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 1080 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  28.23 
 
 		 1240 aa  174  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  23.69 
 
 		 1282 aa  173  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  26.12 
 
 		 1089 aa  172  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  30.02 
 
 		 1123 aa  172  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1177 aa  169  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  27.78 
 
 		 1125 aa  167  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  27.52 
 
 		 1189 aa  165  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2171  Exodeoxyribonuclease V  23.08 
 
 		 1152 aa  162  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  28.01 
 
 		 1061 aa  160  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1057 aa  159  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  22.74 
 
 		 1121 aa  158  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1034  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 1173 aa  156  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0891257  normal  0.693052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  31.65 
 
 		 1196 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.78 
 
 		 1251 aa  151  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 1173 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  23.26 
 
 		 1244 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  25.51 
 
 		 1241 aa  149  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  25 
 
 		 1241 aa  149  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1126  UvrD/REP helicase  26.33 
 
 		 1173 aa  147  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.443367 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  25.63 
 
 		 1242 aa  147  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 1185 aa  147  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.84 
 
 		 1203 aa  147  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.55 
 
 		 1241 aa  146  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.55 
 
 		 1241 aa  146  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.55 
 
 		 1241 aa  146  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.55 
 
 		 1241 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  25.4 
 
 		 1241 aa  146  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  22.95 
 
 		 1204 aa  145  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.22 
 
 		 1183 aa  145  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  24.78 
 
 		 1240 aa  145  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  28.33 
 
 		 1119 aa  144  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  27.89 
 
 		 1106 aa  144  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0769  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.04 
 
 		 1207 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 1124 aa  143  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  25.48 
 
 		 1241 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  25.48 
 
 		 1241 aa  142  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0817  double-strand break repair helicase AddA  26.88 
 
 		 1180 aa  140  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1893  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.04 
 
 		 1200 aa  140  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000174869 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  21.54 
 
 		 860 aa  140  1e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.68 
 
 		 1106 aa  138  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  22.59 
 
 		 1139 aa  137  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3434  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 1187 aa  137  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.27 
 
 		 1251 aa  135  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 1165 aa  132  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  30.34 
 
 		 833 aa  132  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.84 
 
 		 1177 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  28.38 
 
 		 1197 aa  132  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 726 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 1161 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  25.7 
 
 		 1218 aa  130  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2175  double-strand break repair helicase AddA  26.36 
 
 		 1164 aa  130  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  27.7 
 
 		 1121 aa  129  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  29.14 
 
 		 1120 aa  128  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  27.36 
 
 		 762 aa  127  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4671  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.79 
 
 		 1224 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0077  double-strand break repair helicase AddA  27.48 
 
 		 1161 aa  126  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.458203  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  27.84 
 
 		 1187 aa  125  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0178  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.45 
 
 		 796 aa  124  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.349073  normal  0.0817623 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 742 aa  124  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  26.65 
 
 		 805 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.65 
 
 		 805 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.4 
 
 		 798 aa  124  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2352  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  27.04 
 
 		 1355 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.67 
 
 		 781 aa  124  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01028  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.83 
 
 		 1336 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 		 781 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51710  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  25.99 
 
 		 1226 aa  123  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  28.13 
 
 		 657 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.29 
 
 		 772 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.32 
 
 		 786 aa  122  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.91 
 
 		 794 aa  122  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  27.17 
 
 		 1155 aa  121  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.23 
 
 		 795 aa  121  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.57 
 
 		 794 aa  121  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.98 
 
 		 831 aa  121  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1624  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.94 
 
 		 1240 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.547512  normal  0.545211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  22.26 
 
 		 1377 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.48 
 
 		 838 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.76 
 
 		 1186 aa  121  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.6 
 
 		 1240 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0804  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, beta subunit  26.75 
 
 		 1242 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.888497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>