More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2948 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  100 
 
 
333 aa  661    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2271  putative MoxR family protein  79.38 
 
 
332 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  76.65 
 
 
334 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3251  ATPase  77.3 
 
 
346 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.05 
 
 
334 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2626  ATPase  78.15 
 
 
337 aa  513  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1192  ATPase  77.23 
 
 
332 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.464003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1295  ATPase  75.75 
 
 
334 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.962935  normal  0.478279 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  75.54 
 
 
333 aa  499  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.09 
 
 
333 aa  480  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5171  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.19 
 
 
336 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311831  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  74.1 
 
 
336 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  71.08 
 
 
336 aa  474  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  71.08 
 
 
336 aa  474  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  73.09 
 
 
336 aa  474  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  70.77 
 
 
349 aa  466  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  71.21 
 
 
340 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  74.38 
 
 
334 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  70.86 
 
 
335 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1556  moxR protein  70.55 
 
 
335 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1609  ATPase  69.94 
 
 
335 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.22 
 
 
336 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  67.81 
 
 
336 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.84 
 
 
336 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3229  MoxR family protein  66.46 
 
 
342 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  69.74 
 
 
337 aa  434  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1007  AAA family ATPase  63.16 
 
 
343 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.664695  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  64.17 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  62.5 
 
 
332 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  63.35 
 
 
338 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3013  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.87 
 
 
350 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0925287  normal  0.302039 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  63.12 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  63.12 
 
 
338 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3901  ATPase  66.01 
 
 
333 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.186525  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  60.86 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  65.67 
 
 
362 aa  381  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2767  ATPase  62.78 
 
 
335 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.91 
 
 
320 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2500  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.8 
 
 
308 aa  330  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0488  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.77 
 
 
320 aa  323  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1950  ATPase  49.83 
 
 
317 aa  322  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0190  methanol dehydrogenase regulator  53 
 
 
321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.17889  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00950  methanol dehydrogenase regulator-like protein  50.5 
 
 
317 aa  315  5e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3175  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.52 
 
 
379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.336988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0087  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.68 
 
 
327 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.299862  normal  0.0406879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1285  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.92 
 
 
334 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4422  ATPase  53.11 
 
 
338 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1324  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.37 
 
 
327 aa  305  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.430216  normal  0.197723 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
351 aa  302  6.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4268  ATPase associated with various cellular activities, AAA-3  53.14 
 
 
343 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1801  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.59 
 
 
349 aa  299  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.65 
 
 
334 aa  298  6e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4423  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.47 
 
 
341 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.886882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.14 
 
 
341 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.861235  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1689  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.65 
 
 
338 aa  290  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.17 
 
 
325 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  47.67 
 
 
356 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3263  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.62 
 
 
341 aa  283  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302795  normal  0.0121123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1419  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.08 
 
 
345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.52 
 
 
356 aa  282  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0254  ATPase  45.37 
 
 
329 aa  281  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.211212  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3818  ATPase  48.53 
 
 
334 aa  280  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1719  methanol dehydrogenase regulator  47.67 
 
 
324 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1888  ATPase  48.86 
 
 
334 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.277676  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0804  ATPase  47.47 
 
 
324 aa  275  7e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.84 
 
 
334 aa  275  9e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1365  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.52 
 
 
313 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.780175  normal  0.334218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.68 
 
 
333 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1738  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.03 
 
 
333 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1932  moxR-like ATPase  44.9 
 
 
324 aa  271  9e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.41 
 
 
325 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1088  ATPase  45.51 
 
 
318 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.32 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2649  moxR-like ATPase  40.71 
 
 
339 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.342238  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  41.51 
 
 
340 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  41.12 
 
 
332 aa  248  8e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  41.69 
 
 
328 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  45.95 
 
 
320 aa  246  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  43.04 
 
 
330 aa  245  6.999999999999999e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.69 
 
 
341 aa  244  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  40.78 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.02 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  42.09 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  44.52 
 
 
324 aa  242  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  41.23 
 
 
325 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  41.41 
 
 
346 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  42.86 
 
 
337 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.33 
 
 
318 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.82 
 
 
329 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.41 
 
 
318 aa  239  5.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  44.34 
 
 
325 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.79 
 
 
328 aa  238  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.81 
 
 
432 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  43.75 
 
 
321 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  43.09 
 
 
326 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  43.09 
 
 
326 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  40.52 
 
 
328 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.67 
 
 
302 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  41.12 
 
 
340 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.15 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>