54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2912 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  790    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  57.65 
 
 
396 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  47.96 
 
 
408 aa  360  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  47.16 
 
 
422 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  46.08 
 
 
398 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  45.41 
 
 
439 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3261  hypothetical protein  47.72 
 
 
419 aa  325  6e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.389498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  45.9 
 
 
426 aa  324  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  43.88 
 
 
427 aa  322  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0450  hypothetical protein  44.34 
 
 
430 aa  322  9.000000000000001e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2266  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  43.09 
 
 
447 aa  315  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  46.39 
 
 
421 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  46.39 
 
 
421 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  38.22 
 
 
374 aa  232  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  34.9 
 
 
378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  34.9 
 
 
378 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  36.75 
 
 
371 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  34.56 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0527  hypothetical protein  34.94 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.437223  hitchhiker  0.00000299697 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  29.71 
 
 
398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  28.03 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  29.13 
 
 
401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24381  hypothetical protein  27.37 
 
 
429 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  32.64 
 
 
398 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  24.58 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  32.27 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  28.65 
 
 
386 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  31.3 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  27.06 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  26.83 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  25.51 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  27.34 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  32.68 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  28.95 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  30.8 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  29.96 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  24.05 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  28.16 
 
 
431 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  30.77 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  31.67 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  31.32 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  25.29 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  23.87 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  23.67 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  25.48 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  23.87 
 
 
396 aa  56.2  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  28.71 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  28.7 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  24.9 
 
 
400 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  21.83 
 
 
806 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  26.34 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  27.72 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>