More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2851 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  63.79 
 
 
540 aa  677    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
565 aa  1164    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  64.71 
 
 
590 aa  697    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  66.85 
 
 
579 aa  748    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  65.01 
 
 
551 aa  685    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  53.56 
 
 
561 aa  588  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  52.18 
 
 
547 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  53.23 
 
 
555 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  50 
 
 
561 aa  527  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  44.93 
 
 
518 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  40.99 
 
 
537 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3109  resolvase  54.55 
 
 
377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  31.68 
 
 
548 aa  228  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  30.84 
 
 
542 aa  219  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  30.84 
 
 
554 aa  219  1e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  31 
 
 
506 aa  218  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  29.34 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  28.83 
 
 
510 aa  186  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0630  resolvase  42.52 
 
 
247 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 
485 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  27.39 
 
 
494 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.58 
 
 
563 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  27.41 
 
 
613 aa  136  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  26.57 
 
 
546 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.13 
 
 
496 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.76 
 
 
522 aa  123  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  26.36 
 
 
546 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.1 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  24.95 
 
 
521 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  26.8 
 
 
665 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3120  recombinase  46.32 
 
 
173 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.964732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  26.19 
 
 
462 aa  120  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.71 
 
 
515 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.47 
 
 
415 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.06 
 
 
482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.24 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  24.78 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.22 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  26.74 
 
 
534 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  28.39 
 
 
607 aa  115  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.85 
 
 
537 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  26.74 
 
 
534 aa  114  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.62 
 
 
542 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.62 
 
 
542 aa  114  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  25.33 
 
 
582 aa  114  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  26.46 
 
 
544 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.62 
 
 
542 aa  114  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.74 
 
 
534 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.61 
 
 
525 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  24.6 
 
 
534 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0097  resolvase domain-containing protein  35.19 
 
 
211 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.371309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  25.91 
 
 
460 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  25.34 
 
 
743 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  27.62 
 
 
484 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 
445 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  25.71 
 
 
537 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0845  Resolvase domain protein  30.58 
 
 
252 aa  104  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000678199  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 
445 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.99 
 
 
511 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  27.33 
 
 
484 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  24.3 
 
 
528 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  25.05 
 
 
565 aa  102  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  24.54 
 
 
528 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  25.72 
 
 
562 aa  102  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  26.3 
 
 
445 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.94 
 
 
447 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2714  putative cassette chromosome recombinase resolvase, CcrB like  26.85 
 
 
641 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0173703  normal  0.344103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.95 
 
 
525 aa  97.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  25.31 
 
 
569 aa  95.9  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  25 
 
 
520 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  24.69 
 
 
441 aa  95.1  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 
504 aa  94.7  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  27.81 
 
 
548 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.25 
 
 
525 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25 
 
 
558 aa  94  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  24.18 
 
 
441 aa  94  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  24.87 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.33 
 
 
429 aa  92  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  26.52 
 
 
532 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  22.78 
 
 
534 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  25 
 
 
549 aa  91.3  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.19 
 
 
505 aa  90.9  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  27.73 
 
 
515 aa  89.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.89 
 
 
558 aa  90.1  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  21.18 
 
 
539 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4607  resolvase-like protein  26.72 
 
 
476 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  25.59 
 
 
578 aa  88.6  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0096  hypothetical protein  28.05 
 
 
261 aa  87.8  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  26.09 
 
 
541 aa  87  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5207  Resolvase domain protein  25.75 
 
 
598 aa  87  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  23.65 
 
 
576 aa  86.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2966  Resolvase domain protein  23.83 
 
 
524 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  26.51 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  21.81 
 
 
558 aa  85.5  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5028  hypothetical protein  35.85 
 
 
185 aa  84.7  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.284216  normal  0.520699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  25.09 
 
 
549 aa  84.7  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1282  Resolvase domain protein  26.18 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5975  recombinase  25.34 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  23.44 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5572  recombinase  25.34 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0686025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>