240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2837 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 364 aa  716    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  48.35 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  48.35 
 
 		 365 aa  345  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  48.5 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  48.08 
 
 		 362 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  45.6 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  47.53 
 
 		 362 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  46.17 
 
 		 365 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  47.53 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  47.25 
 
 		 362 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  46.7 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  46.7 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  49.18 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  48.9 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  48.9 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0555  permease YjgP/YjgQ family protein  48.35 
 
 		 363 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0678448 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  44.38 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  39.62 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  39.89 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1758  permease YjgP/YjgQ  40.11 
 
 		 359 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  38.46 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  38.36 
 
 		 369 aa  235  9e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  35.44 
 
 		 363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  38.46 
 
 		 362 aa  233  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  37.81 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  35.67 
 
 		 362 aa  212  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  35.93 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2627  permease YjgP/YjgQ family protein  39.29 
 
 		 376 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3075  permease YjgP/YjgQ  34.32 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20702  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  34.25 
 
 		 364 aa  195  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  33.33 
 
 		 364 aa  189  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1813  permease YjgP/YjgQ  35.15 
 
 		 364 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.578456  normal  0.607435 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2529  permease YjgP/YjgQ family protein  34.29 
 
 		 367 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.337345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1189  permease YjgP/YjgQ family protein  34.93 
 
 		 365 aa  182  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216183  normal  0.433432 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0948  permease YjgP/YjgQ  33.7 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.046524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  32.01 
 
 		 365 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  31.65 
 
 		 373 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  27.1 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  27.96 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.59 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  26.74 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  25.34 
 
 		 359 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  26.78 
 
 		 364 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.71 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  24.67 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2809  permease YjgP/YjgQ  24.68 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.652763  normal  0.723942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  25.14 
 
 		 353 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0564  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 356 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000725936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 369 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  23.65 
 
 		 355 aa  86.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2744  permease YjgP/YjgQ family protein  27.54 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2685  permease YjgP/YjgQ  24.61 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283535  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  24.18 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  25.65 
 
 		 360 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  23.62 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  24.23 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  26.22 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 353 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.74 
 
 		 359 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 792 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  24.73 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  25.99 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  27.36 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  27.47 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  23.65 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  25.2 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  27.13 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.86 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  23.4 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  25.27 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0991  permease YjgP/YjgQ  28.16 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215925  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  25.27 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3555  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  24.72 
 
 		 359 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.09 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  24.93 
 
 		 366 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0390  permease YjgP/YjgQ family protein  25.68 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0209469  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  27.64 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  24.7 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  24.37 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  22.25 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02855  conserved hypothetical protein  25.25 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000166888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3446  YjgP/YjgQ permease  26.01 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02804  hypothetical protein  25.25 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000115691  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  26.28 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0714  permease YjgP/YjgQ family protein  25.25 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  25.34 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  26 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>