171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2819 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
315 aa  635    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  52.7 
 
 
344 aa  324  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 
314 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  51.43 
 
 
314 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  51.75 
 
 
314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  50.16 
 
 
315 aa  311  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  51.11 
 
 
314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  47.78 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  50.16 
 
 
315 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  45.66 
 
 
330 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  45.66 
 
 
330 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  46.47 
 
 
333 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  45.34 
 
 
329 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  43.73 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  45.72 
 
 
345 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  44.55 
 
 
331 aa  245  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  44.55 
 
 
331 aa  244  9e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  43.69 
 
 
323 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 
333 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  42.68 
 
 
347 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  44.67 
 
 
303 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  41.85 
 
 
324 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 
337 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
324 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  38.92 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  37.27 
 
 
332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  36.25 
 
 
320 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  37.62 
 
 
314 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  34.46 
 
 
329 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 
329 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  34.92 
 
 
345 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  34.54 
 
 
315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  35.57 
 
 
314 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  34.58 
 
 
327 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
327 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 
327 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  34.47 
 
 
327 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  34.24 
 
 
327 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
337 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
337 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  34.36 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  32.9 
 
 
345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  35.51 
 
 
317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  31.85 
 
 
333 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  31.05 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  33.9 
 
 
345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  29.07 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 
324 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  32.35 
 
 
338 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  30.23 
 
 
331 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  31 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  31.14 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  31 
 
 
331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  28.16 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  29.01 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  32.08 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  31.76 
 
 
331 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  31.43 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  28.62 
 
 
638 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  30.74 
 
 
338 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  30.74 
 
 
338 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  30.74 
 
 
338 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  30.74 
 
 
338 aa  109  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  30.74 
 
 
338 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  25.68 
 
 
318 aa  108  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  31.86 
 
 
340 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  29.12 
 
 
330 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 
302 aa  102  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  30.19 
 
 
355 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  24.48 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  28.57 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
288 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 
315 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
284 aa  62.4  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 
263 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
290 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  28.76 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
302 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>