More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2779 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2779  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 863 aa  1747    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  38.71 
 
 		 829 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 819 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  36.93 
 
 		 829 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  37.06 
 
 		 821 aa  488  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.65 
 
 		 817 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  37.63 
 
 		 812 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  37.3 
 
 		 778 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.39 
 
 		 833 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2140  ferrichrome receptor precursor protein  37.08 
 
 		 740 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  35.71 
 
 		 806 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1338  TonB-dependent siderophore receptor  36.53 
 
 		 815 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  35.31 
 
 		 801 aa  443  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  35.31 
 
 		 799 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35.81 
 
 		 808 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  37.53 
 
 		 769 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.04 
 
 		 797 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  34.32 
 
 		 806 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3577  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  38.34 
 
 		 718 aa  425  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.601026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  33.65 
 
 		 828 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  34.63 
 
 		 797 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  33.76 
 
 		 828 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2374  TonB-dependent siderophore receptor  35.02 
 
 		 822 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.18637  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6718  ferrichrome receptor precursor protein  35.87 
 
 		 719 aa  416  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0249127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 794 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  33.41 
 
 		 820 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  33.05 
 
 		 810 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  33.06 
 
 		 828 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  33.14 
 
 		 810 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  34.73 
 
 		 729 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  33.1 
 
 		 808 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  34.19 
 
 		 791 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  34.19 
 
 		 791 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 810 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  35.82 
 
 		 831 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  36.45 
 
 		 771 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3474  ferrichrome receptor precursor protein  35.07 
 
 		 719 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  33.6 
 
 		 810 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3585  ferrichrome receptor precursor protein  35.72 
 
 		 718 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.885271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  33.45 
 
 		 802 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  35.16 
 
 		 771 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 		 789 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1006  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 726 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 		 723 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 744 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  35.37 
 
 		 744 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003567  ferrichrome-iron receptor  31.84 
 
 		 740 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 750 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  34.5 
 
 		 729 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  33.55 
 
 		 733 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  33.96 
 
 		 729 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  31.79 
 
 		 797 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 		 745 aa  381  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4098  TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 754 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  33.73 
 
 		 729 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4135  ferrioxamine B receptor precursor protein  33.97 
 
 		 726 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  32.77 
 
 		 779 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001284  putative iron(III) compound receptor  32.51 
 
 		 701 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000165675  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2192  ferrioxamine B receptor precursor protein  34.14 
 
 		 724 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.411084  decreased coverage  0.00773577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  34.25 
 
 		 703 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  34.28 
 
 		 753 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  34.25 
 
 		 703 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 		 733 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  34.49 
 
 		 729 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  35.09 
 
 		 748 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4798  TonB-dependent siderophore receptor  35.03 
 
 		 724 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4673  TonB-dependent siderophore receptor  34.34 
 
 		 727 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  34.12 
 
 		 736 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0725  TonB-dependent receptor protein  38.35 
 
 		 633 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  35.21 
 
 		 757 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  34 
 
 		 735 aa  366  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  35.2 
 
 		 745 aa  365  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 745 aa  364  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 741 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 752 aa  363  6e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 736 aa  363  8e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  32.86 
 
 		 736 aa  363  8e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  32.68 
 
 		 753 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  32.68 
 
 		 753 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  34.85 
 
 		 750 aa  362  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 747 aa  362  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  32.94 
 
 		 737 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 		 738 aa  360  4e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 717 aa  360  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 		 828 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0885  TonB-dependent siderophore receptor  34.21 
 
 		 794 aa  359  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22630  TonB-dependent siderophore receptor protein  31.27 
 
 		 799 aa  352  1e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  33.38 
 
 		 752 aa  351  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 701 aa  350  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  32.71 
 
 		 745 aa  350  8e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  32.99 
 
 		 747 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 740 aa  348  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  32.99 
 
 		 747 aa  347  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 784 aa  347  5e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5955  TonB-dependent siderophore receptor  32 
 
 		 877 aa  347  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0124539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3064  TonB-dependent siderophore receptor  33.29 
 
 		 719 aa  347  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.981244  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  33.46 
 
 		 747 aa  346  8e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  33.46 
 
 		 747 aa  346  8.999999999999999e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 696 aa  345  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>