253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2660 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  712    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  712    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  68.62 
 
 
355 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  74.27 
 
 
324 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  67.08 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  64.33 
 
 
348 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  65.88 
 
 
352 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  60.62 
 
 
355 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  56.07 
 
 
339 aa  331  9e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0605  hypothetical protein  54.21 
 
 
351 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.982935  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  40.57 
 
 
338 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2759  hypothetical protein  41.18 
 
 
348 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1256  hypothetical protein  36.66 
 
 
361 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158959  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  40.24 
 
 
355 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  38.36 
 
 
361 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  38.36 
 
 
361 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2349  inner membrane protein YeiH  41.69 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000430251  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2551  inner membrane protein YeiH  41.69 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2441  inner membrane protein YeiH  41.69 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2437  hypothetical protein  41.69 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  hitchhiker  0.00533282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2393  inner membrane protein YeiH  41.38 
 
 
349 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0110407  hitchhiker  0.000836246 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  40.28 
 
 
348 aa  200  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  38.05 
 
 
346 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  40.19 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  40.19 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  40.19 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  40.19 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  40.19 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  40.19 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  40.19 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  40.19 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  39.5 
 
 
349 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  37.38 
 
 
340 aa  192  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  40.6 
 
 
356 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1630  hypothetical protein  41.42 
 
 
359 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.464978  normal  0.369724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1657  hypothetical protein  37.77 
 
 
343 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2281  hypothetical protein  37.12 
 
 
365 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  32.91 
 
 
337 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3226  hypothetical protein  41.05 
 
 
362 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000050779 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  40.94 
 
 
356 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  36.72 
 
 
340 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  40.6 
 
 
356 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  40.6 
 
 
356 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2755  hypothetical protein  39.74 
 
 
362 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.218534  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2674  hypothetical protein  39.74 
 
 
362 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1533  hypothetical protein  39.74 
 
 
362 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212301  normal  0.210583 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  36.07 
 
 
340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1657  hypothetical protein  36.28 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1523  hypothetical protein  38.99 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1762  hypothetical protein  39.68 
 
 
343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  35.2 
 
 
352 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  37.35 
 
 
357 aa  184  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  34.87 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  34.87 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  34.87 
 
 
340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5032  hypothetical protein  38.68 
 
 
355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.35937 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  35.74 
 
 
340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  35.29 
 
 
340 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2132  hypothetical protein  39.26 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.861594  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2292  hypothetical protein  39.49 
 
 
420 aa  179  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1845  hypothetical protein  38.87 
 
 
360 aa  178  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0726233  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  36.72 
 
 
340 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  35.53 
 
 
352 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1878  hypothetical protein  34.91 
 
 
341 aa  176  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395194  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  33.89 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  34.87 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2242  hypothetical protein  36.74 
 
 
353 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1977  hypothetical protein  36.81 
 
 
365 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284569  normal  0.0203812 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6170  hypothetical protein  42.45 
 
 
355 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  34.41 
 
 
340 aa  170  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71100  hypothetical protein  42.09 
 
 
355 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3661  hypothetical protein  36.77 
 
 
353 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.143776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  38.25 
 
 
372 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2420  hypothetical protein  36.53 
 
 
361 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5713  hypothetical protein  41.98 
 
 
361 aa  169  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0304105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2325  hypothetical protein  35.29 
 
 
359 aa  169  8e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  33.53 
 
 
345 aa  169  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2242  hypothetical protein  37.1 
 
 
353 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1253  membrane-fusion protein  38.13 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0469672  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  32.99 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  35.47 
 
 
368 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1990  hypothetical protein  37.54 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.81385  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2068  hypothetical protein  36.77 
 
 
353 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  32.64 
 
 
341 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2972  hypothetical protein  35.87 
 
 
339 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.678695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  31.49 
 
 
377 aa  159  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1030  hypothetical protein  36.14 
 
 
411 aa  159  8e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.706838 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1714  hypothetical protein  32.68 
 
 
363 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2308  hypothetical protein  39.93 
 
 
360 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0344  hypothetical protein  35.37 
 
 
325 aa  157  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2819  hypothetical protein  39.93 
 
 
360 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.720965  normal  0.298888 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4868  hypothetical protein  35.05 
 
 
345 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1678  Uncharacterized protein family UPF0324  32.68 
 
 
340 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0389  hypothetical protein  31.23 
 
 
331 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445768  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0399  hypothetical protein  31.23 
 
 
331 aa  155  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0517  hypothetical protein  33.86 
 
 
327 aa  155  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.433081  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3934  hypothetical protein  37.36 
 
 
336 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0111  hypothetical protein  30.87 
 
 
331 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5197  hypothetical protein  40.31 
 
 
365 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  34.12 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>