47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2621 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  761    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1908  hypothetical protein  43.13 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.344277 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0071  hypothetical protein  40.25 
 
 		 244 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.878621  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0824  hypothetical protein  73.75 
 
 		 345 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0510  hypothetical protein  45.65 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.0447134 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0953  hypothetical protein  43.75 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0203333  normal  0.0141438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  67.09 
 
 		 425 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0095  hypothetical protein  52.48 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0612  hypothetical protein  79.69 
 
 		 231 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0916  hypothetical protein  69.33 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  40.81 
 
 		 315 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7607  hypothetical protein  79.37 
 
 		 284 aa  109  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00689527  normal  0.216662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0375  hypothetical protein  78.69 
 
 		 231 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1798  hypothetical protein  53.77 
 
 		 261 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  65 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0468  hypothetical protein  78.69 
 
 		 240 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3953  hypothetical protein  68.66 
 
 		 294 aa  106  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3522  hypothetical protein  76.19 
 
 		 244 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00855265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2997  hypothetical protein  72.73 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0114  hypothetical protein  70.15 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2500  hypothetical protein  73.02 
 
 		 219 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1865  hypothetical protein  53.4 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1038  hypothetical protein  69.84 
 
 		 263 aa  98.2  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0341013  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0247  hypothetical protein  51.02 
 
 		 216 aa  95.1  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0988  hypothetical protein  52.81 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4586  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1749  hypothetical protein  44.37 
 
 		 248 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0140  hypothetical protein  52.33 
 
 		 144 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  0.0783474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1016  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  85.1  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1808  hypothetical protein  50.62 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0648  hypothetical protein  56.16 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0943  hypothetical protein  56.45 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1731  hypothetical protein  52.78 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0545738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6078  hypothetical protein  58.46 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1550  hypothetical protein  58.46 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0360168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1115  hypothetical protein  58.46 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0896  hypothetical protein  53.85 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0019435  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2712  hypothetical protein  35.8 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0286  hypothetical protein  38.26 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2176  restriction endonuclease  62.12 
 
 		 669 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4223  ribonuclease E  58.33 
 
 		 1053 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2292  hypothetical protein  60 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.281162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2528  hypothetical protein  37.84 
 
 		 269 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0991  ribonuclease  48.35 
 
 		 1059 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.19075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  23.12 
 
 		 3409 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2357  translation initiation factor IF-2  62.79 
 
 		 1101 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2492  Ig-binding B domain-containing protein  48.65 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2444  Ig-binding B domain-containing protein  48.65 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>