84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2608 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2608  cytochrome c class I  100 
 
 		 361 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1092  cytochrome c class I  61.56 
 
 		 333 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0320  cytochrome c family protein  52.92 
 
 		 369 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0353  cytochrome c family protein  52.5 
 
 		 357 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2825  cytochrome c, class I  44.98 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.137044  hitchhiker  0.000380249 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6947  cytochrome c class I  43.44 
 
 		 358 aa  250  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4873  cytochrome c class I  41.55 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0259  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 331 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0286  OmpA/MotB  39.01 
 
 		 329 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2599  cytochrome c family protein  40.73 
 
 		 306 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.349522  normal  0.253602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0128  putative cytochrome C  34.69 
 
 		 352 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0408235  normal  0.127267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5211  putative cytochrome c  40.47 
 
 		 675 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0072933  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60490  putative cytochrome c  42.01 
 
 		 675 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00637068  normal  0.0584653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  38.28 
 
 		 269 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2072  cytochrome c, class I  37.76 
 
 		 712 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1476  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  35.94 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03090  putative cytochrome C signal peptide protein  36.33 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.649207  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0524  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1496  cytochrome c class I  39.08 
 
 		 308 aa  156  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3370  cytochrome c, class I  39 
 
 		 691 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384758  normal  0.0138407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0193  cytochrome c, class I  37.77 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  35.17 
 
 		 698 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1071  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  36.21 
 
 		 699 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2378  cytochrome c, class I  37.04 
 
 		 282 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000643985  hitchhiker  0.0000202689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0690  cytochrome c class I  35.44 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0817  cytochrome c, class I  38.57 
 
 		 669 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04472  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0408  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2155  cytochrome c, class I  35.03 
 
 		 728 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0527  cytochrome c family protein  34.42 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000661478  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3191  cytochrome c class I  36.8 
 
 		 304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2708  cytochrome c, class I  33.55 
 
 		 343 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.993605  normal  0.111519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2214  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  37.45 
 
 		 689 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143053  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0804  cytochrome c family protein  37.07 
 
 		 721 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2499  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.09 
 
 		 726 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.345014  normal  0.965839 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2348  cytochrome c family protein  37.07 
 
 		 694 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.903737  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003030  cytochrome c family protein  33.81 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4606  cytochrome c, class I  36.48 
 
 		 309 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000163718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1415  cytochrome c, class I  37.56 
 
 		 708 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.526567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0786  cytochrome c, class I  37.34 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3822  cytochrome c family protein  36.91 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1948  cytochrome c, class I  36.91 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.510162  normal  0.709424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3537  cytochrome c class I  36.13 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429309  normal  0.0523965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1441  putative cytochrome c  32.04 
 
 		 311 aa  143  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.668743  normal  0.951652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2484  cytochrome c family protein  36.29 
 
 		 721 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0635463  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5989  Cytochrome c  38.46 
 
 		 773 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4236  cytochrome c class I  34.24 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00185461  normal  0.468789 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2757  hypothetical protein  35.6 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0570414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1943  c-type cytochrome  32.93 
 
 		 327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2236  cytochrome c, class I  33.09 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.472913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32540  hypothetical protein  35.43 
 
 		 293 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.277482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4179  cytochrome c, class I  31.71 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402721  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0624  cytochrome c, class I  35 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000503789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0544  cytochrome c class I  35.42 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0573  cytochrome c class I  36.51 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0568  cytochrome c class I  37.19 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1309  diheme-containing SoxA-like protein  31.85 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4047  cytochrome c family protein  35.68 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0520  cytochrome c, class I  35 
 
 		 351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3431  cytochrome c, class I  35.68 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3606  cytochrome c family protein  35 
 
 		 352 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1184  cytochrome c, class I  31.85 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0075  cytochrome c family protein  31.67 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.667536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0051  cytochrome c family protein  31.67 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0036  cytochrome c family protein  31.67 
 
 		 347 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.170219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3545  cytochrome c family protein  32.5 
 
 		 372 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0884  cytochrome c family protein, degenerate  49.59 
 
 		 125 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2490  cytochrome c class I  32.78 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0885  cytochrome C  39.58 
 
 		 181 aa  116  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2583  cytochrome c class I  30.95 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1278  cytochrome c, class I  33.01 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0536255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2105  cytochrome c, class I  29.39 
 
 		 315 aa  106  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1188  cytochrome c, class I  41.13 
 
 		 139 aa  85.9  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2387  hypothetical protein  30.96 
 
 		 671 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0416918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0653  cytochrome c  41.18 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.963006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1187  cytochrome C  40 
 
 		 79 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2754  Cytochrome c-like protein  31.48 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0564833  hitchhiker  0.0019216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3714  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.09 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.873772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1906  diheme cytochrome SoxA (sulfur oxidation)  26.09 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.556317  normal  0.0839186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7671  putative diheme cytochrome c; sulfur oxidizing protein SoxA  31.07 
 
 		 258 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5470  cytochrome c, class I  29.33 
 
 		 631 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.343465  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0205  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 647 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0202  cytochrome c, class I  31.4 
 
 		 647 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0180  cytochrome c family protein  27.68 
 
 		 636 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.558942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>