More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2586 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  100 
 
 
138 aa  273  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  79.39 
 
 
137 aa  213  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  79.39 
 
 
142 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  79.55 
 
 
144 aa  210  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 
150 aa  209  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  81.3 
 
 
136 aa  207  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  76.92 
 
 
137 aa  207  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  76.56 
 
 
129 aa  206  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  79.71 
 
 
138 aa  206  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  75.19 
 
 
133 aa  206  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  75.38 
 
 
135 aa  204  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  72.79 
 
 
137 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  74.05 
 
 
138 aa  203  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  74.81 
 
 
135 aa  203  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  74.24 
 
 
133 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  81.16 
 
 
138 aa  200  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  81.16 
 
 
138 aa  200  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  75.76 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  75.76 
 
 
132 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  78.99 
 
 
138 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  72.52 
 
 
138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  72.52 
 
 
138 aa  197  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  71.97 
 
 
133 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  72.73 
 
 
133 aa  197  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  78.99 
 
 
138 aa  196  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  75 
 
 
132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  69.85 
 
 
134 aa  189  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  75.21 
 
 
135 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  66.18 
 
 
136 aa  185  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  68.18 
 
 
132 aa  185  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  71.09 
 
 
128 aa  184  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  69.7 
 
 
132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  66.42 
 
 
151 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  76.07 
 
 
146 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  64.12 
 
 
347 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
334 aa  168  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  61.67 
 
 
137 aa  158  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  55.64 
 
 
138 aa  154  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  62.7 
 
 
142 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  58.78 
 
 
135 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
153 aa  110  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  47.24 
 
 
313 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  45.67 
 
 
315 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  47.41 
 
 
149 aa  100  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  43.61 
 
 
318 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  44.88 
 
 
315 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  45.67 
 
 
316 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  46.21 
 
 
314 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.75 
 
 
310 aa  93.6  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  39.37 
 
 
329 aa  93.6  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  45 
 
 
312 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  43.61 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  40.98 
 
 
306 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.73 
 
 
316 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  43.61 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.61 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  41.73 
 
 
316 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  43.48 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
135 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 
128 aa  90.1  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
129 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.3 
 
 
133 aa  89.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  41.18 
 
 
315 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.42 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0143  Mutator MutT  39.55 
 
 
352 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
129 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.42 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  39.85 
 
 
400 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.42 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  36.64 
 
 
129 aa  87.8  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  41.88 
 
 
317 aa  87.4  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  40.65 
 
 
314 aa  87.4  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  38.58 
 
 
314 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 
138 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  39.37 
 
 
313 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  40.91 
 
 
320 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  43.85 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  45.19 
 
 
329 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  45.19 
 
 
329 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>