More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2513 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 268 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  65.87 
 
 		 229 aa  280  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 226 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  52.11 
 
 		 226 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  48.9 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 231 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 225 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  52.09 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 226 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  43.94 
 
 		 224 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  41.31 
 
 		 224 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  44.22 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 223 aa  159  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 223 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 223 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 229 aa  148  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  40.38 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  39.32 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  36.19 
 
 		 222 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 206 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 214 aa  129  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 224 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 226 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 222 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  38.65 
 
 		 225 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 267 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 229 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 245 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  34.91 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  35.07 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  30.34 
 
 		 219 aa  103  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 222 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 235 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2775  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  37.1 
 
 		 232 aa  99.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  35.15 
 
 		 217 aa  98.6  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 210 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 236 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 231 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 213 aa  95.5  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 232 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 235 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 219 aa  94  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 227 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 228 aa  93.2  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  34.54 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.16 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 209 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>